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中国农业科技导报,2011,13 (4):58 - 65
Journal of Agricultural Science and Technology
宏转录组学在微生物生态学研究中的应用
, , , , ,
李晓晖 李鑫鑫 张 维 燕永亮 陈 明 陆 伟
( , 100081)
中国农业科学院生物技术研究所 北京
: 、
摘 要 宏转录组学是一门在整体水平上研究某一特定环境 特定时期群体生物全基因组转录情况以及转录
。 ,
调控规律的学科 概述了新兴的宏转录组学在微生物生态学研究中的进展 并总结了其与微生物宏基因组
。 , ,
学研究方法相比的优缺点 宏转录组学是一种新颖有效的方法 在微生物生态学 甚至在复杂微生物群落的
生态学研究中都具有广阔的应用前景。
: ; ; ;
关键词 宏转录组学 原理 特点 微生物生态
doi :10 . 3969 /j . issn. 1008-0864 . 2011. 04 . 09
中图分类号:Q789 文献标识码:A 文章编号:1008-0864 (2011)04-0058-08
Application of Metatranscriptomics in Microbial Ecology
LI Xiao-hui ,LI Xin-xin ,ZHANG Wei ,YAN Yong-liang ,CHEN Ming ,LU Wei
(Biotechnology Research Institute ,Chinese Academy of Agricultural Sciences ,Beijing 100081,China)
Abstract :Metatranscriptomics is an area to study the gene transcriptional rules of certain organisms in specific
environment and time. This paper summarized the progress of metatranscriptomics on microbial ecology ,and
compared its advantages and disadvantages with meta-genomics. Metatranscriptomics has a promising future as a
direct and efficient method to study transcription and gene regulation in microbial ecology and with complex microbial
communities.
Key words :metatranscriptomics ;principle ;characteristic ;microbial ecology
[1], 落有了更加深入的了解[4]。20
自然界中微生物的多样性非常复杂 绝大 世纪兴起的宏基
多数微生物不能通过传统纯培养的方法在培养皿 因组学(metagenomics)通过大规模的测序技术,
。 , 1% ~ 5%
上进行培养和分离 研究显示 只
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