基因表达调控和选择性剪接机制研究.pdfVIP

第12A期 电 子 学 报 ～m29H012^ 2001年12月 ACTAELECTRONICASINm 腩20。l 基因表达调控与选择性剪接机制研究 闻芳，李衍达 清华大学生物信息研究所智能技术与系统国家重点蛮验室．北京100084) 摘要：随着人类基因组计划(HGP)的完成，生物信息学的研究进人了后基因组时代，用计葬片法对基因表达 词控和基因功能进行研究成为生物信息学研究的核一15内容由于在真核基因表达j吲控中的特殊地位，选择性剪接成为 研究真核基因表达调控的重要内容之一．本文从收集选择性剪接基因的数据出发，尽可能的收集已知的选择性剪接的 基因和它们的各种转录产物，并进行r适当的筛选以保证数据的质量和统、1分析的可靠性．对挑选出的371个入类基 因、提取各种转录产物的编码区(codirt#regions，或简称cds)，应用一种新的针对选择性剪接的多序列比刈程序 ≈S．MAGN进行多序列比对来揭示不同cds闸的剪接关系，提出其中的口了变区域与不可变区域．并刘町变医域与f可变 区域的长度分布，可爱区域在cds巾出现的位置，由于选择性剪接引起的同一段序列读码框相位的变化姒及可蛮区域 与不可喹区域及■者边界卜的密码子使用频率进行了统计分析，得到了一屿裉有意思的结果这些统计纬果对T选掸 性剪接机制的进一步研究以及选择性剪接基因的预测提供了良好的线索 关键词： 选择性剪接；多序列比耐；基因结构；剪接模式 J1 A 中圈分类号： Q 文献标识码： 文章编号：0372—2112(2001)12A—1735—05 ABioinformaticof GenesofHuman AnalysisAlternativelySpliced WFN Yan—da Fang．1．I lnstiaae可Bioi,Co,matics，Tsu埘lmStatFblalsJmury《i,m．1llgem㈦uu曲野andsystan，4i*100084，Ch／na Urd懈rsity Abstract：Withthe ofHumanGenorrre hasenteredthe era of completion draft，bioinfomtatic_mrcIIpost-#ⅧcStudying has r㈣amhForits theeonFmlof andfunction methods homethen】alnstJeⅢof spe— geneexpression usingcomputationalgradually cialroleinthecontrolof hasbecomean researchInthis etfi,aryntic imporlallttopicin$rMmiP geneexpression，ahemafi～esplicing alternativeofhunchbasedo／1