结合叶绿体基因matK／trnK序列与生境分析不同生态型芦苇的系统发育.pdfVIP

第 45卷第 3期 兰州大学学报 (自然科 学版) VOl1．45NO．3 2009年 6月 JournalofLanzhouUniversity(NaturalSciences) Jun．2009 文章编号：0455—2059(2009)03—0050—05 结合叶绿体基因matK／／trnK序列和生境分析 不同生态型芦苇的系统发育 龚晓洁，闫广为，浦铜 良 (兰州大学 生命科学学院植物学及植物生理研究所，兰州 730000) 摘 要：以甘肃省临泽县境 内的4种生态型芦苇(PhragmitescommunisTrin．)的18个样品为材料，采 用PCR扩增技术 以通用引物 “matK．FF74”和 m“atK—trnK一2R”扩增matK／trnK序列，对纯化后的 产物进行序列测定和分析．序列 比对软件为ClustalW，系统发育软件分析为PAUP4bl0并用 以构 建MP和ML发育树和计算遗传距离，外群为芦竹 (Arundodonax1．结果表 明：matK／trnK序列长 为1745~1753bp，含有91个简约信息位点和120个可变位点，获得3个严格一致树．MP树和ML树共 同说明水生芦苇是最古老的类群，它与沙丘芦苇之间的遗传距离最远，重度盐渍过渡型芦苇和轻度盐 渍过渡型芦苇属于中间过渡类群． 关键词：生态型芦苇；系统发育；遗传距离；最大简约法；最大似然法；甘肃省临泽县 中图分类号：Q94．15 文献标识码：A Analysisofphylogenyofdifferentecotypesofreed(Phragmites communisTrin．)basedonchloroplastDNAmatK／trnK sequenceand ecologicalenvironment GONGXiao-jie． Ⅳ Guang—wei．PUTong—liang (InstituteofBotanyandPlantPhysiology，SchoolofLifeSciences，LanzhouUniversity，Lanzhou730000，China) Abstract：18reedsamplesofofurecotypes(PhragmitescommunisTrin．)fromLinzeCounty,GansuProvince wereusedasmaterialsandtheirDNAwereisolatedwithCTABmethods．matK／trnKsequencesofchloro— plastgenomewereamplifiedwithprimerpairsnamedmatK—FF74andmatK—trnK一2R，thenPCR products weresequencedandanalysedbyClustalW softwareandPAUP4bl0software．Analysismethodsweremaxi— mum parsimonymethodandmaximum likelihoodmethod．Thedatawereusedforreconstructingthephy— logenetictreesandcalculatingthegeneticdistanceamongthesefourecotypes．Arundodonax wasregarded asanoutgroup．TheresultsindicatethatthelengthsofamplifiedmatK／trnKsegmentsareapproximately 1745~1753bpinthesamples，containing91parsimonyinformationsitesand120variablesites．Themajor— ityparsimonytreeiscondensedfrom 3maximum parsimonytreesanditisindicatedthatswampreedisthe oldestecotype，