药用植物DNA条形码物种鉴定技术.pdfVIP

6·48 · Jou rnal of Ch inese M edicinal M aterials　　第 33卷第 4 期 20 10年 4 月 药用植物 DNA 条形码物种鉴定技术 陈　念 ,赖小平 (广州中医药大学中药学院 ,广东 广州 5 10006) 　　摘要 　DNA 序列的变异程度是决定其能否作为 DNA 条形码进行物种鉴定的主要因素 。本文对系统发育研究 中常用的 DNA 序列标记在药用植物 DNA 条形码鉴定研究中的使用效果进行了评价 ,如当前已知序列最多的 2 种 ( ) ( ) 标记 ———质体编码的核酮糖 1, 5二磷酸羧化酶 /加氧酶大亚基 rbcL 和核核糖体大亚基内转录间隔区 ITS , 以及 变异程度相对较高的质体 psbA trnH 区域等 ,均有很大的用于中药材 DNA 条形码鉴定的潜力 。单亲遗传的质体或 线粒体基因组仅能提供物种分类所需的部分信息 ,因此其在物种分类研究中的应用尚不够完善 ,但其在短期内已 足以解决物种鉴定研究中所遇到的实际问题 ,且随着新的条形码物种鉴定工具的开发 ———如变异显著且容易扩增 的核基因标记等 ,包括对杂交后代进行检测在内的其它难题也将得到很好地解决 。 关键词 　药用植物 ; DNA 条形码 ;物种鉴定 ;分类 中图分类号 : R282 5　　文献标识码 : A 　　文章编号 :(20 10) ( 　　DNA 条形码 DNA B arcode,也曾叫 DNA taxon 域的研究者来说更具有利用的价值 ,如在法医、贸易 ) om y 物种鉴定技术当前正在飞速发展当中。在动 和海关动物检疫等领域 ,尤其是在对中药材等 DNA 物和真菌研究领域 ,线粒体细胞色素氧化酶亚基 Ⅰ 容易发生降解的样品进行鉴定时 ,质体 DNA 条形码 ( ) 〔1, 2 〕 〔5 〕 cox Ⅰ基因已得到了广泛地应用 ,其对于藻类 应用的优势非常明显 。当然 ,高质量的核酸样品 和远缘的多细胞生物也有一定的应用价值 〔3 〕。但 是确保 DNA 条形码准确性的前提 ,但这对于以大量 对于植物来说 ,无论是 cox Ⅰ基因还是一些已广泛 新鲜植物标本作为实验材料的种群遗传学研究来说 ( 用于系统发育研究的质体基因组编码区域 如 rbcL 、 并非首要考虑的因素 。 ) ( 〔6 〕 ( a tpB 、ndhF 和 m a tK 基因外显子 和非编码区域 如 Go ldb latt等 分别以肖鸢尾属 M oraea ,约 250 ) ) ( ) trnL 内含子和 trnL F 基因间隔区 ,均存在变异程度 个种 和山龙眼属 P rotea ,约 85 个种 为研究对象 较小且缺乏足够的系统发育信息位点的问题 ,这也