石斛属植物rbcL基因序列变异与系统发育初步研究.pdfVIP

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2015-07-21 发布于安徽
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石斛属植物rbcL基因序列变异与系统发育初步研究.pdf

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MEDICINEANDMATERIAMEDICARESEARCH2009VOL．20NO．7 时珍国医国药2009年第20卷第7期LISHIZHEN 石斛属植物rbcL基因序列变异和系统发育初步研究袁佐清，张建勇，刘涛 (山东理工大学生命科学学院，山东淄博255049) 基因序列设计一对引物，用于石斛rbeL基因PCR扩增。基因序列排列用ClustalX软件完成，应用Seqnconverter软件分 4．1软件分析转换值、颠换值、转换／颠换比；采用最大简约法析序列的长度、GC含量、GpC量、GCskew值等；用Mega 000次。结果10种 (maximumparsimonymethod)获得最大简约系统树；应用自展法(bootstrap)检验系统树，自展次数为l bp为变异位点，439 石斛植物叶绿体rbcL基因的长度范围为944—950bp。其中536bp为保守位点，466 bp为具有系统发 2—0．082 1。序列转换／颠换比(Si／Sv)为0．9。结论利用PCR和核酸测序方法可以获得rbcL基因的核苷酸序列，能为石斛植物的系统发育研究提供核苷酸序列方面的资料。关键词：石斛；rbeL基因；序列分析；系统发育中图分类号：R2—03；R282．71文献标识码：A 文章编号：1008-0805(2009)07—1836-02 of VariationofrbcLGeneand Dendrobium Relationship Species Sequence Phylogenetic (Orchidaceae)Plants YUAN Tao Zuo-qing，ZHANGJian—yong，LIU (SchoolofLifeScience，ShandongUniversityofTechnology，Zibo255049，China) To the variationofrbeLGeneand ofDendrobium Abstract：Objectiveexploresequence Phylogeneticrelationship plants． MethodsA of was to therbcL contentsof contentsof pairprimersdesignedamplify gene．Genesequence，theG+C，the GpC， thevalueof andsi／svwere u- GCskew，transitionsal pairs，transversionalpairs conducted．Phylogeneticanalysis惴conducted the