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HEREDITAS (Beijing) 2008 7 , 30(7): 933―940
ISSN 0253-9772 研究报告
DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00933
EST-SSRs
1 2 1 3
王静毅 , 陈业渊 , 刘伟良 , 武耀廷
1. , 571101;
2. , 571737;
3. , , 570228
摘要:从NCBI 搜索的2 282 条香蕉EST 中, 发掘出含有SSR 的EST 序列 110 条, 共有 122 个SSR 位点, 检出
率为5.3% 。SSR 位点可分为37 种重复单元, 平均长度为20 bp, 其中二、三核苷酸重复单元的SSR 占主导地位,
分别占总SSR 的33.1%和47.6% 。GA 和GAA 是二、三核苷酸中的优势重复类型, 分别占二、三核苷酸重复类
型的 75.7%和 36.0%; 其他重复类型所占比例均不足 10%, 而四核苷酸重复类型最少, 为 4.0% 。设计的 63 对
EST-SSRs 引物中, 有41 对EST-SSRs 引物对巴西蕉基因组DNA 能扩增出产物, 占总引物数的65.1% 。应用进
一步筛选出的重复性好、多态性高的19 对引物对49 个香蕉品种(系)进行PCR 扩增。每对引物扩增的多态性带
数目为4~12 个, 平均7.58 个; 引物多态信息量变化范围为0.3572~0.8744, 平均0.7324 。在相似系数为0.63 的
水平可将 49 个品种聚为 2 个类群:一类为含 B 基因组香蕉品种; 另一类为不含 B 基因组的香蕉品种, 表明
EST-SSR 引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究。
关键词:香蕉; EST; EST-SSR; 遗传多样性; 聚类分析
Development and application of EST-derived SSR markers for ba-
nanas (Musa nana Lour.)
1 2 1 3
WANG Jing-Yi , CHEN Ye-Yuan , LIU Wei-Liang , WU Yao-Ting
1. Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences (CATAS), Haikou 571101, China;
2. Institute of Tropical Crops Genetic Resources , CATAS, Danzhou 571737, China;
3. Ministry of Education Key Laboratory of Tropical Horticulture Plant Resources Genetic Improvement, College of Horticulture, Agri-
cultural Collage of Hainan Universit, Haikou 570228, China
Abstract: A total of 2 284 banana unigene sequences were mined, resultin
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