人与其他生物基因组若干重要问题的生物信息学研究§.pdfVIP

* 专题评论 * 人与其他生物基因组若干重要问题的生物信息学研究*§ 张春霆 天津大学生物信息中心，天津 300072 摘要 Z 曲线是表示 DNA 序列的一个等价的三维空间曲线。通过对 Z 曲线的研究来对基因 组序列进行研究是一种几何学的途径。我们用这种思路研究了真核和原核基因组中若干重要 问题，包括人与高等真核生物基因组的 Isochore 结构，微生物基因组的基因水平转移，古 细菌基因组复制起始位点识别，酵母基因组基因识别，细菌与古细菌基因组的 ab initio 基因识别，SARS-CoV 基因组基因识别，高 G+C 含量微生物基因组的结构，比较基因组学以 及分子进化等的研究。文中综述了天津大学生物信息中心最近 6 年来，在上述研究中所取得 的进展。 关键词 基因组 基因组学 生物信息学 几何学 Z 曲线 天津大学生物信息中心成立于 1998 年初，迄今已有 6 年多的历史。在这期 间，人类基因组计划基本完成，模式生物基因组计划也正如火如荼地进行着，所 积累的基因组 DNA 序列的数目成倍地增长，呈“爆炸”之势。人类与其他生物 基因组序列是大自然的伟大作品