QTL定位方法的研究进展.pdfVIP

试验研究 CAOYEYUXUMU 2012年第5期总第198期草业与畜牧 周明亮 ，纳巴他 ，张显泽 ，张清建 ，杨平贵 (1．四川省草原科学研究院，四川 成都 611731；2．四川省松潘县畜牧兽医局，四川 松潘 623300； 3．四川省甘孜州畜科所 ，四川 康定 626000；4．四川省金川县沙耳乡畜牧兽医站，四川 金川 624100) 摘要：随着分子生物学技术与数量遗传学的发展，在动植物上进行QTL定位成为现代生物科学研究的重要领域。定 位过程中，一系列的定位方法得到研究与应用，本文就QTL定位的方法进行了综述。 关键词：QTL；侯选基因法；统计分析；阚性状分析 中图分类号：Q78 文献标识码：A 文章编号：1673—8403(2012)05—0018—06 1909年瑞典生物学家Nilsson—Ehle提出了数量性状 分析的QTL定位方法，如最小二乘的法、最大似然分 的遗传模型—多基因假说 (PolygeneHypothesis)[1]，认 析法等 ；基于阈性状分析的统计方法 ，如贝叶斯分 为数量性状是由微效多基因控制的，对导致数量性状 析、非参数方法。 变异的所有基因的总效应进行了很好的分析，但不能 1 QTL定位的前提 用经典的孟德尔遗传方法来区分单个基因的作用。 1．1 QTL定位的原理 Gelderman2[于 1975年提出了控制数量性状的数量性 分子生物学技术的发展以及较高密度遗传连锁图 状位点 (QuantitativeTraitLoci，QTL)的概念，认为 谱的构建成功，允许研究人员通过一定的试验杂交群 它是占据染色体某一特定区段，对数量性状的变异有 中分子标记的分析来确认QTL4[]。利用遗传标记进行 较大影响效应的单一基因或紧密连锁的基因簇，一个 数量性状基因位点定位的遗传基础是个体带有连锁信 数量性状可能受到多个基因簇的影响。2O世纪60年 息，遗传标记必须与控制数量性状的基因位点位于同 代初，Thodayb提出在分离群体中利用足够数量的标 一 染色体上，呈现较紧密连锁 ，处于连锁不平衡状 记构建数量性状遗传图谱的可能性和方法，但并未能 态，数量性状基因位点的探测及定位通常是建立在下 得到广泛的应用。20世纪80年代 以来，分子生物学 述假定的基础之上：遗传标记和数量性状基因位点遵 得到了快速的发展，人类基因组 (HCG)计划的开 循孟德尔遗传规律；数量性状基因位点在整个基因组 展，促进了分子标记技术的发展，自从RFLP作为遗 上分布稀少，如发现显著的效应，是由单个数量性状 传标记研 究 以来 ，先后产生 了RFLP、RAPD、 基因位点所影响的；数量性状基因只有二个等位基因 AFLP、SSR、SNP等类型的分子标记。满足了QTL定 (Q及q)；遗传标记对该数量性状没有一因多效性； 位的条件，QTL在染色体上的定位成为一个崭新的研 数量性状基因位点与其它基因位点不存在交互作用。 究领域。 只有在遗传标记与数量性状基因位点有连锁的情况 近年来，数量性状的基因定位的统计方法是当今 下，才可能由遗传标记来探测及定位数量性状基因位 世界的一个热点研究领域，其发展非常迅速，主要有 点 。 以下几种方法在动植物上进行QTL定位：侯选基因 1．2 试验群体 法；基于标记信息与陛状的QTL定位方法，如单标记 植物或实验动物主要应用近交系间杂交 (Inbred 分析法、双标记分析法、多区间分析法等；基于统计 linecrossing)产生分离群体 (F：群体 、回交群体等) 来进行QTL定位 暗。近交系杂交的优点是不同的近交