胃癌和癌旁组织定量比较蛋白质组学研究.pdfVIP

中国生物工程杂志 　Ch ina B iotechno logy, 2007 , 27 ( 7) : 55 ～60 胃癌及癌旁组织定量比较蛋白质组学研究 1 1 2 3 1 1 1 罗治文 　谢笑娟 　马桂兰 　呼建文 　刘丽杰 　葛文松 　朱 　　 ( 1 第二军医大学附属长征医院消化科 　上海 　200003　2 解放军第 513 医院　兰州 　732750 3 中国科学院上海生命科学院蛋白质组研究分析中心　上海 　20003 1) 摘要 　为寻找胃癌特异的肿瘤标记物 ,用于胃癌临床诊断及药物治疗靶点的选择 ,采用荧光差异 ( ) 显示凝胶电泳 D IGE 技术分离并筛选 Cy3、Cy5 及 Cy2 荧光素标记的胃癌及对应癌旁组织差异 ( ) 表达蛋白质 ,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 MALD ITOF M S 或串联质谱技术进行鉴定 并分析 。结果共筛选出 33 个差异表达蛋白质点 ,其中 9 个蛋白质点在胃癌组织中上调 , 24 个蛋 白质点下调 。对 22 个蛋白质点采用质谱技术成功鉴定 ,突变结蛋白、锰超氧化物歧化酶 、热休克 蛋白 60 等在胃癌中高表达 ,热休克蛋白 27、前列腺素 F 合酶 、硒结合蛋白 1、锌指蛋白 160、微管 α α 蛋白 6、真核生物翻译延伸因子 1 1等在胃癌组织中低表达 ,并筛选出 5 个未知蛋白。这些差 异表达蛋白可望成为胃癌诊断的特异标记物 ,并与胃癌的发生 、发展及预后等有关 ,为 胃癌的诊 断、发生机制的研究提供了新的思路 。 关键词 　胃癌 　肿瘤标记物 　D IGE　定量蛋白质组学 中图分类号 　Q 819 　　胃癌是常见的消化道恶性肿瘤 ,死亡率仅次于肺 别标记不同的蛋白质样品 ,并设立内标 ,可以在同一个 癌 [ 1 ] 。每年全世界有 750 000 患者死于 胃癌 [2 ] ,我国每 双向凝胶上同时分离两种以上蛋白质样品 , 比较同一 年有 16 万人死于胃癌 [ 3 ] ,而胃癌高死亡率的主要原因是 蛋白在不同组织中的丰度比[ 10, 11 ] 。 没有有效的早期筛选和诊断方法 [4 ] ,因此 ,寻找早期诊断 　　本研究中,采用 D IGE 技术筛选并鉴定了胃癌及其 和筛选的有效方法对提高胃癌生存率非常重要 。 癌旁组织的差异表达蛋白质 , 寻找 胃癌组织特异蛋 白 　　近年来 , 蛋白质组学技术已经成为研究临床肿瘤 质标记物 , 以用于临床 胃癌筛查和诊断 , 并为寻找 胃癌 疾病普查和早期诊断蛋白质标记物的有效工具 , 同时 治疗药物靶点、了解 胃癌发生发展的分子机制提供了 为研究肿瘤产生和发展的机制提供了技术平台[ 5～7 ] 。 思路 。 有 作 者 用 双 向 凝 胶 电 泳 ( twodim en sional gel ) 1　材料与方法 electrop horesis, 2 D E 技术结合质谱技术筛选并鉴定了 胃癌组织相关的一些蛋白质 [ 8, 9 ] 。但普通 2 D E 技术存 1. 1　标本采集及处理 在敏感性 、特异性 、重复性较差 ,对疏水蛋白、小分子蛋 　　3 例胃癌及癌旁组织均来 自第二军医大学附属长 白、膜蛋白分离有限等不足 。荧光差异显示凝胶 电泳