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猪繁殖与呼吸综合征病毒57非编码区顺式作用元件的解析
高飞,韦祖樟,陆嘉琦,袁世山,童光志·
(中国农业科学院上海兽医研究所/中国动物卫生与流行病学中心上海分中心猪病防治研究室上海200241)
and vi
摘要:猪繁殖与呼吸综合征病毒(PorcinereproductirerespiratorysyndromerLIS,PRRSV)是引起猪繁殖与
呼吸综合征的病原,此病以母猪繁殖障碍和仔猪呼吸系统症状为特征。是世界养猪业的一个巨大的威胁。近年来,此病给各
制、亚基因组mRNA的合成和蛋白翻译、病毒颗粒组装以及病毒致病机理等许多问题目前正待解决。目前,大量研究已经证明,
PRRSV基因组的5’非编码区(5’UTR)对病毒复制至关重要,但是目前对其存在的顺式作用元件和调控功能还知之甚少。
UTR5’
本研究基于实验室构建的II型PRRSV全长感染性克隆,构建了一系列5’ 端缺失突变体以及两型UTR互换的突变
7
5
体,通过RNA/DNA转染、病毒拯救、病毒学分析等,初步解析了的PRRSVUTR一些顺式作用元件的结构与功能,对进一
步剖析病毒致病机理有重要意义。现将研究内容简述如下:
1.猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非翻译区存在与病毒感染性相关的顺式调控元件
7
UTR5’
本研究基于北美型(II型)PRRSV弱毒株感染性克隆pAPRRS的骨架,构建了一系列在5端
缺失的突变全长克隆,通过体外转录的RNA转染和直接DNA转染,病毒拯救及后续病毒学检测,结果显示:
7
PRRSV5 UTR的5’端前3个碱基可以缺失,对病毒的感染性基本无影响;5’ 端前16个碱基的保守性
对病毒非必需,但是拯救的病毒随着碱基缺失的增多,复制的第一轮病毒在MARC一145细胞上的滴度明显降
低,其后随着突变病毒在MARC一145细胞上传代,其复制效率得到一定程度的恢复,但降低的趋势未改变。
UTR进行的二级结构预测分析发现,
缺失突变病毒的5’ 端被一系列AU—rich的序列来修复。后续对5’
外源序列使得SLl得以修复,综上所述,病毒5’端前16个碱基的保守性对病毒复制是非必须的,其所形
成的SLl对病毒的感染性至关重要。
7
2.5UTR57端序列缺失体外源序列修复分析
为了进一步研究猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因组57非翻译区的结构与功能,本研究利用上
述5’UTR5’末端缺失的突变体病毒,利用5’RACE技术对突变病毒的57末端进行测序分析。在研究过程
启动子转录起始位点有所不同,我们人为引入一段GC—rich的序列以判断上述修复过程是否为模板依赖性。
7
5
结果证明,病毒的外源序列修复机制是非模板依赖性的。通过二级结构预测分析发现,在PRRSVUTR中
的第一个茎环结构(SLl)是病毒感染性必不可少的。
发挥作用
本研究将欧洲型PRRSV
毒学分析比较发现,在病毒复制、空斑形态、基因组负链复制和亚基因组转录等层面,嵌合病毒与亲本毒
差异不显著。I型5’UTR在功能上可完全替代II型的5’UTR。
4.异源5’非翻译区在猪繁殖与呼吸综合征病毒感染性拯救过程中的功能解析
——567--·
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