基于本体医疗健康服务术语管理方法与研究与应用.pdfVIP

基于本体的医疗健康服务术语管理方法研究与应用 ① ② ① ② 冯乐桐 刘璘 叶晓俊 曹战强 ① 清华大学软件学院，100084， ② 北京大学口腔医院，100081， 摘 要 首先针对我国医疗信息数据标准的现状，国际上异构的医学术语集，数据互操作等问 题，分析了在健康服务过程中工程师需要面临的跨领域知识鸿沟的挑战。在此基础上，提出了 一种基于本体的健康服务知识抽取与构建医疗术语知识库的解决方法。参考现有国外广泛应用 的针对于特定医疗领域的本体，抽象医学术语描述模型，遵循本体构建流程完成适用与给定应 用场景的知识库的构建。为涵盖多种术语集，包换多个医学领域的术语内容，提供了便于快速 查询的网状索引。不同术语集间映射关系的构建有效地减少了术语集的重复性。由于医学术语 的覆盖范围和数据量庞大，目前仅就口腔临床相关应用领域进行了基础性探索。该知识库的完 成预期为医疗服务应用提供标准数据源，并为医生医疗提供辅助。 关键词：本体；医学术语；医疗信息系统；知识库 1 引言 医学术语管理是医疗健康服务领域走向标准化的重要环节，需要知识工程师通过和用户与 领域专家的持续交互共同完成的知识工程活动。由于在知识抽取过程中需要对医疗健康服务 的行为和运行情境进行抽象和提炼，因此需要工程师对目标领域内的术语可以准确地领会并 建立正确的关联关系。这就要求工程师常常需要跨越领域知识的鸿沟，对系统目标领域的知 识进行深入的学习和掌握。在现实中，许多领域知识分布分散难以收集，且大部分属于经验 型知识，难于使用语言准确地描述。另一方面，由于各类相关人员具有不同的知识背景，对 问题本身也有着不同的着眼点，沟通上的困难也使需求的抽取和系统的分析工作变得更加艰 难。 基于本体的方法是计算机科学与信息科学领域管理领域知识的最有效方法之一，它基于领 域的公共术语建立概念间的层次关系，表示概念的类型，属性和相互关系。是促进大数据分析 技术在医疗健康领域应用的重要基础性工作，它对人工智能、语义网、系统工程、软件工程、 生物信息学、商务智能等相关领域发展产生了深刻而广泛的影响。 针对现实中健康数据服务的实际需求，结合基于本体的知识管理理念，我们提出了一套基 于本体的医疗健康服务术语管理与知识抽取方法。这套方法借助医疗健康领域原有的结构化 术语知识库，以直观的领域知识图为中心，通过情境案例和动态组建的服务共同体，引导工 程师有效地从用户代表和领域专家处获取领域知识。这种方法减少了传统知识抽取工作中工 程师初涉目标领域时获取知识的盲目性。同时，该方法也增强了经验性知识的获取效果，促 进了对客观知识之间关联关系的认知。 本文按照以下形式组织：第一部分分析了领域知识抽取工作所面临的困难；第二部分介绍 了使用本体进行知识库建设的具体方法；第三部分结合 HL71标准模型与口腔健康服务领域的 案例讨论如何在现实环境中使用本体提供应用的知识服务工作；第四部分总结全文并介绍了 下一步工作。 2 基于本体的医学术语知识库构建 2.1 基于本体的知识库 医疗术语是一个非常庞杂的知识体系，国内、国外均有多种针对不同 应用领域的医学术语集，例如国际上针对实验室观测指标的术语集 LOINC2，针对国际疾病分 类的术语集 ICD3-9 和 ICD-10，针对医务流程编码的术语集CPT4等；国内也制定了相应的标 准集如：GBT 9937.1，GBT 9939.3，GBT 9937.5 等针对医疗专科 （口腔）的术语集。随着医 疗技术的发展和医学知识的不断完善，术语将动态更新、新增或废弃，因此需要一定的组织 形式对其进行有效的管理。 知识库作为数据库与人工智能两项计算机技术的有机结合5，便于有关领域知识的采集、 整理以及提取，可以作为动态管理医疗术语的技术支撑。一个结构完善的医疗术语知识库可 以将庞杂的医疗知识有序化，大大缩减术语的查询和整理时间，加快医疗知识和信息的流动， 可以为其他系统与应用提供标准的数据源，便于医疗领域专家对术语进行动态维护，也提供 了一种知识组织形式便于领域外人士的学习。 知识库有多种表现形式，考虑到医学术语集的庞大和复杂关联关系，选取基于本体6的语 义网作为医疗术语知识库的展现形式。 2.2 基于本体的知识库构建[1] 基于领域现有的术语集合，构建一个综合的医疗健康服务本体 的过程主要分为以下四步：1）确定本体的范围，明确本体要解决的问题。2）调研现有可重 用的相似本体，获取可利用信息。3）抽