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Animal Medicine and 1.31(2) 实验动物与比较医学Laboratory Comparative 147 Apr.201 1.02.019 doi:10.39690.issn.1674—5817.201 斑马鱼分子遗传位标及多态性研究进展 赵莹1.2,沈志敏1,3,刘雄伟L3,魏晓锋L3,胡建华1,3 (1.上海实验动物研究中心,上海201203; 2.上海西普尔.妊凯实验动物有限公司,上海201203) 3.上海市实验动物质量监督检验站,上海201203) 【摘要】过去二十年间,分子遗传位标可揭示DNA水平的多态性,在斑马鱼的遗传研究中所占比 重越来越大。本文介绍分子遗传位标及斑马鱼遗传图谱,探讨这些遗传位标使用时的优缺点,展 示斑马鱼品系的多态性。 【关键词】分子遗传位标;RAPD;SSCP;STR;SNP;多态性;斑马鱼 【中图分类号】Q95.33【文献标识码】A 【文章编号]1674—5817(2011)02—0147—06 斑马鱼(Daniorerio,zebrafish)原产于东印度、 1分子遗传位标 巴基斯坦和缅甸的小溪稻田以及恒河中游,为小型 的热带鱼类。其基因组的大小只有人类的一半, 分子位标可以帮助科学家们揭示生物体I内DNA 而它的血液、肾、和视觉系统与人类相似;同时它 水平的多态性状态,过去20年间被广泛应用于实 具有类似无脊椎动物的优势,较其它脊椎动物简 验动物的遗传研究。在小鼠、大鼠、斑马鱼等模 单;其繁殖刷期短,养殖简单;其外,它的胚胎受 式动物的遗传研究中,分子位标使用、开发非常 精及发育都在体外进行,胚体完全透明,便于观 深入,为研究丁作提供了良好的环境和技术基础。 察胚胎发育的全过程,并且追踪个体细胞的分裂和 选择分子位标一般会考虑两个要素:首先,分 迁移活动。因此,斑马鱼被誉为研究人类遗传基 子位标必须易于分型且成本低;其次,选择时根据 因的功能的理想生物。 实验需求,考虑分子侥标的特性,如:位标的显隐 在20世纪70年代初,美国俄勒冈大学分子生性、信息含量、图谱中所在位置等l引。 物研究所从事脊椎动物神经系统发育的George 从分子结构而言,分子位标可归为3类:一个碱 Streisinger教授开始把斑马鱼做为试验对象。1981基的不同,SNP;一至上百个碱基的插入缺失,Indels; 年,关于斑马鱼人工雌核发育的研究在Nature上发 多个串联重复序列引起的差异,VNTR。按一个位点 表后lll,斑马鱼开始受到生物学家们的关注。短短 所携带的信息,可归纳为2类:二等位位标,如:RAPD、 三十年的时间里,斑马鱼的家族遍布了世界各地的 研究所。大景的遗传学工作,加速了斑马鱼分子 于分子遗传位标的这些特点,其形成原理和检测手段 遗传位标的研究。 在实验动物中基本是一致的。但是由于研究热点以及 品系遗传状态不同,分子位标在各模式生物中的开发 【收稿日期】2010.07.07 使用及信息完善程度不尽形同。相对大、小鼠,斑 【基金项目】上海市科学技术委员会创新行动计划项目 马鱼近交品系较少。在近二十年的研究中,常用的斑 (NO.07

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