原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
论文题目：部分红麻MYB转录因子基因
序列的生物信息学分析
学 院： 生命科学学院
专业年级： 生物技术 2011级
学 号： 3115405030
姓 名： 陈志超
指导教师、职称： 徐建堂 副研究员
2015年 月 日
Bioinformatics analysis on part of MYB transcription factor in Kenaf （Hibiscus cannabinus L.）
Submitted in partial fulfillment of the requirements for the degree of Bachelor in School of Life Sciences, FAFU
College: School of Life Sciences
Speciality: Biotechnology
Entrance year:2011
I.D. No.: 3115405030
Candidate: Chen Zhichao
Supervisor: Associate Prof. XU Jiantang
Submitted: In May, 2015
目 录
1
英文摘要 1
1引言 1
1.1研究意义 1
1.2前人研究进展 2
1.3本研究切入点 3
1.4拟解决关键性问题 3
2材料与方法 3
2.1 试验材料 3
2.2 总DNA提取 4
2.3 目的基因的克隆与生物信息学分析 4
2.4 PCR扩增 4
3结果与分析 5
3.1红麻DNA提取结果 5
3.2红麻MYB的PCR结果 6
3.3 PCR产物测序结果（铂尚测序公司） 7
3.4 DNAMAN比对结果 7
3.5进化树 12
3.6 ORF分析 13
4讨论 15
4.1 DNA提取与目的片段扩增 15
4.2 关于目的片段引物设计 15
4.3转录组测序结果验证 16
5结论 16
参考文献 16
致谢 18
部分红麻MYB转录因子基因序列的生物信息学分析
陈志超 福建农林大学，生命科学学院，生物技术 2011级
摘要：通过对红麻MYB相关转录因子进行序列验证分析，为下一步开展MYB基因全长克隆奠定基础。对红麻MYB转录组数据分析，从中筛选出92条与MYB相关序列，进行进化树分析。从红麻转录组中随机挑选8条MYB基因，利用ligo7 软件设计特异引物，以品种福红7号基因组总DNA 为模板进行中间片段扩增，利用DNAMAN8软件及NCBI Blast进行序列比对分析。其中7条MYB相关因子的基因序列相似度达99%以上，经分析后均能获得转录组序列的开放阅读框。，为下一步开展MYB基因全长克隆及功能验证奠定良好基础。
关键词：红麻，MYB转录因子，转录组，基因克隆，比对分析
Bioinformatics analysis part of MYB transcription factor in Kenaf （Hibiscus cannabinus L.）
Chen zhichao, Fujian Agriculture and Forestry University, college of life science, Department of Biotechnology , Major of Biotechnology , Grade 2011, No.3115405030
Abstract: Based on kenaf MYB related transcription factor sequence analysis, to provide a basis for kenaf MYB gene cloning. Through the analysis of Kenaf transcriptome data, a total of 92 MYB transcription factor related sequence were selected from the data, and then analysis its phylogenetic tree. Eight kenaf MYB gene sequences were randomly selected from the data, using software oligo7 to design specific primers, wi
文档评论（0）