GENOME+SHUFFLING技术优化及其应用进展.pdfVIP

2010年4月 广西轻工业 第4期(总第137期) GUANGXIJOURNALOFLIGHTINDUSTRY’食品与生物 -_—_—_-_·_——_——_—--·—————_—_——_·一I GENOME HUFFLl N S G技术优化及其应用进展 付婕琴，胡昌华 (西南大学药学院，重庆400716) Genome 【摘 要】 shuffling作为一种新型的育种方法，与传统方法相比更加高效快捷，近年来不断被应用于制药、食品 制品、环境工程等众多领域的茵种改良中。对genomeshuffling近年来技术的优化及其应用进展进行综述。 【关键词】 genomeshuming；基因组重排；菌种改良 【中图分类号】Q93 【文献标识码】A 【文章编号】1003—2673(2010)03—10—02 微生物菌种在发酵工业中的重要性使得育种技术一直以 组中不同位点的多个基因的重排，突变库遗传背景越丰富，融 来都倍受人们关注。自上个世纪以来，微生物育种技术先后经 合过程中的重排效果越佳，所以genomeshuffling第一步就是 shuf- 历了自然选育，诱变育种，杂交育种，代谢控制育种和分子育种 建立起具有明显遗传差异的阳性突变子库。在genome 等阶段。虽然育种技术的发展是沿着从低效到高效，随机到定 fradiae进行诱变筛选。随着 向的趋势，但遗憾的是在实际应用中都还存在着一定的局限 等仅利用NTG对Streptomyces 6等 性。20世纪90年代中期，美国加州Maxgen公司Cardayrgenomeshuffling技术研究的深入，人们越来越倾向于采用多 种诱变方法来丰富突变库的遗传背景。08年，Yu翻等采用了 人首次提出了genomeshuffling(基因组重排)的概念，并成功 rhamnosus对 的将此种新技术应用于菌株表型的改良。成为了菌株改良史上 NTG和uV两种诱变方法来增强Laetobaeillus 又一新的里程碑。 葡萄糖的耐受性以提高乳酸的产量。08年，zhao瞪事则分别采 sylvi— 1 90I10moshuffIing技术的建立和原理：forme的孢子进行诱变，再对诱变后分离到的高产菌株继续进 行组合诱变。 1994年，stemmer等率先提出了DNA改组技术(DNA 2．2标签的选择 shuffling)。DNAshuffling在一定程度上模仿了生物体自然进 化过程中减数分裂期等位基因间的DNA片段交换，主要针对 在突变库的融合过程中，为了提高筛选效率，常常会选择 于DNA片段，而生物体中的绝大部分表型却是受到多个基因 含有特定标签的突变子来作为出发菌株。02年Zhan91等选取 四种营养缺陷性菌株来判定基因组重排过程中的重组效率，实 协同调控，鉴于此局限性，stemmer等又进一步提出了全基因 验中发现递推式融合可大大提高子代细胞间的基因重排。 组重排技术(genomesh