蒺藜苜蓿WRKY转录因子密码子使用偏好性分析.pdfVIP

，薹乏k麓 寂璺生■援曦孽鬟 =瓣j。。二孟j 簇 胁…Onli冀ne 愿‰ s篓ystem：鬻器。．。rg酊 ．罂曼 蒺藜苜蓿WRKY转录因子密码子使用偏好性分析 宋辉1王鹏飞1马登超2夏晗1赵传志1张烨1赵术珍” l山东省农业科学院生物技术研究中心／山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室，济南250100：2山东省济宁市农业科学研究院 济宁272131 +通讯作者，zhaoshuzhen51@126．com 摘要密码子使用偏好性普遍存在于各种生物中，但突变和自然选择压力对每种生物密码子使用偏好 性不同。WRKY基因家族是一类只存在于植物的转录因子，主要参与植物体内转录调控和信号转导过 程。本研究以蒺藜苜蓿(Medicago 密码子使用偏好性形成的主要因素，并筛选最优密码子。研究结果表明，代表MtWRKY基因的点均分布 量；GC3s值分布在0．2～0．5之间，表明密码子使用偏好性主要受突变压力影响。奇偶偏好分析表明， 明密码子使用偏好性受到自然选择压力影响，但很可能突变压力仍起主要作用。最优密码子使用频率 (frequencyofoptimal 含子序列的形成受不同选择压力影响：外显子密码子使用偏好性受突变压力影响，而内含子可能是由于 自然选择压力作用于突变选择形成的。确定了4个以G或C结尾的最优密码子。研究结果为WRKY转 基因研究过程中密码子优化提供了理论支持。 关键词蒺藜苜蓿，WRKY，突变选择压力，自然选择压力，密码子偏好性 ofCodon BiasofWRKY Factorsin Analysis Usage Transcription truncatula Medicago SONGHuilWANG MA XIAHanlZHAOChuan—ZhilZHANGYel Peng—Feil Deng—Cha02 ZHA0Shu—ZhenP 1 Provincial of Genetic and Research LaboratoryCrop Improvement，Ecology Center,Shandong Shandong Key Physiology,Bio-tech Academy ofAgriculturalSciences，Jinan250100，China；2 272131，China JiningResearchAcademyofAgriculture，Jining +Correspondingauthor,zhaoshuzhen51@126．tom I ina of relative AbstractCodonbiashasbeendocumentedwide contributions usage diversity species．The