2009《蛋白质组学》试题.docVIP

重庆医科大学 2009级硕士研究生《蛋白质组学》试题 姓名： 所在大班：二班 学号： 得分： 交卷时间：2010.01.08 交卷方式：各小班班长收集并按学号整理试卷后上交 交卷地方：东大楼临床生化教研室 一、解释： 1、Two-dimensional Gel Electrophoresis 2、MALDI TOF MS 3、蛋白质组学研究中的in silico生物学 4、亚细胞蛋白质组学 二、简要说明蛋白质组学在临床医学或疾病研究中的应用。 三、通过互联网进入/ ，在阅读Plasma Proteome Project中Overview of project的基础上，介绍该项目的研究内容。 四、将文献Proteome Analysis of Hepatocellular Carcinoma by Two-dimensional Difference Gel Electrophoresis（Fuchu He et al，Molecular Cellular Proteomics 6:1798-1808, 2007）中的ABSTRACT翻译成中文。 五、药物蛋白质组学的主要研究领域有哪些？ 六、蛋白质组学在研究与应用上有哪些局限性？ 1、Two-dimensional Gel Electrophoresis：即双向凝胶电泳,它是当前蛋白组学研究中分辨率最高，信息量最大的分离技术，它的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离，第二向则按分子量的不同用SDS分离，把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。 2、MALDI TOF MS：即基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱，MALDI-TOFMS（Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry）原理是：当用一定强度的激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜，基质从激光中吸收能量，样品解吸附，基质-样品之间发生电荷转移使得样品分子电离，电离的样品在电场作用下加速飞过飞行管道，根据到达检测器的飞行时间不同而被检测，即测定离子的质量电荷之比（M/Z）与离子的飞行时间成正比来检测离子。 MALDI-TOF-MS的中心技术就是依据样品的质荷比（/Z）的不同来进行检测，并测得样品分子的分子量。具有灵敏度高、准确度高、分辨率高、图谱简明、质量范围广及速度快等特点，在操作上制样简便、可微量化、大规模、并行化和高度自动化处理待检生物样品，而且在测定生物大分子和合成高聚物应用方面有特殊的优越性是近年来发展起来的一种软电离新型有机质谱近年来已成为检测和鉴定多肽、蛋白质、多糖、核苷酸、糖蛋白、高聚物以及多种合成聚合物的强有力工具已成为生命科学领域蛋白质组研究中必不可缺的重要关键技术之一。in vivo（体内）与in vitro（体外）这两个名词， In silico强调使用计算机来解决生物学问题，In silico生物学是生物学与信息学的交叉学科。生物信息学已经成为蛋白组学研究中必不可少的组成部分，其应用包括：编码的DNA序列的寻找与分析,蛋白质序列信息的获取,蛋白质鉴定和性质预测,蛋白质结构和功能预测,蛋白质序列分析,数据的分析与整合 。 4、亚细胞蛋白质组学：是利用蛋白质组学研究技术来分析一种组织或细胞亚结构蛋白质组成。细胞内成分根据空间结构、分布及功能的不同，分成不同的细胞器或细胞区域，如细胞膜、胞浆，线粒体、溶酶体、过氧化物酶体、内质网、细胞核和高尔基体等：另外，细胞器内一些功能单位多是大分子结构或蛋白质复合体，如核基质、剪接体、纺锤体、核孔结构及核糖体等，对这些亚细胞器结构蛋白质组学研究可以更好地理解全细胞蛋白。 二、简要说明蛋白质组学在临床医学或疾病研究中的应用。 答：蛋白质组学在疾病的研究中占有十分重要的地位，旨在运用蛋白质组学的研究手段，通过比较正常和病理情况下细胞、组织或体液中蛋白质在组成成分、表达水平、表达位置和修饰状态上的差异，寻找疾病诊断和预后的特异性蛋白质，包括特异性抗原及相关抗原、受体、酶等，以及药物治疗的靶标等。通过对疾病相关功能蛋白质进行定性、定量和表征研究，深入了解这些蛋白质的结构和功能，揭示疾病过程中细胞内全部蛋白质的活动规律，为疾病发生、发展机制的阐明和早期诊断及治疗提供理论依据和解决途径。 三、通过互联网进入/ ，在阅读Plasma Proteome Project中Overview of project的基础上，介绍该项目的研究内容。 答: 血浆蛋白质组计划（PPP）2003年到2005年的计划是：制备人和并个参与，人类血清和血浆蛋白质测和识别综合数据库用、分馏、质谱分析和免疫通过搜索和注释基因和蛋白数据库。创建了一