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Potyvirus属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法.pdf

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Potyvirus属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法.pdf

第 卷 第 期 病 毒 学 报 18 4 VoI . 18 No . 4 2 0 0 2 年 1 2 月 CHI NESE JOURNAL OF VIROLOGY Dec . 2 0 0 2 PotyVirus 属成员基因组全序列的简并 引物PCR 和RACE 扩增方法 陈炯,陈剑平 (浙江省农业科学院病毒室,浙江 杭州 31002 1) 关键词:马铃薯 病毒属;简并引物;全序列测定 Y 中图分类号: 文献标识码: 文章编号: ( ) S432 .4 1 A 1000 - 872 1 2002 04 - 037 1 - 04 马铃薯 病毒属(enus Pot virus )是已确定的 息学原理,分析登录的植物病毒核苷酸序列来设计 Y g y 植物病毒属中最大的一类,有约 200 个种类被 简并引物,扩增未知序列的方法已有不少报道,但研 [,] 究多限于病毒基因组 1 2 ICT V 接受为确定成员或可能成员,占已发现的植 3 - 末端区域序列 。本文 物病毒总数的20 % ,且新成员数量仍在不断增加, 通过分析设计Potyvirus 属简并引物,初步建立了该 是种类最多、寄主范围最广、经济意义最大的病毒 属未知成员基因组全序列的PCR 和 RACE 技术快 属。该属成员单链正性 RNA 基因组长度一般在 速扩增方法。 个核苷酸左右, 末端具有 ( )尾,含 对已知全序列的 属成员编码的多聚 10 000 3 - poIy A Potyvirus 单一的大开放读码框,先翻译成多聚蛋白,随后自催 蛋白氨基酸序列作多重序列分析后,根据保守氨基 化裂解为10 个成熟产物。该属成员基因组全序列 酸序列,设计并筛选出5 个属特异性PCR 简并引物 的克隆方法通常采用双链 克隆,但由于基因 (表 )。 cDNA

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