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美国国立生物技术信息中心对序列数据库的责任美国国立生物技术信息中心Entrez),生物医药科学检索系统(PubMed), 位点链接(LocusLink)和NCBI提供的软件工具BLAST),唯一人类基因序列集合(UniGene),RefSeq),开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子基因组蛋白相邻类的聚簇癌症基因组剖析计划基因表达汇编三维蛋白质结构的分子模型数据库美国国立生物技术信息中心.就可以获得所有的资源。
介绍:
位于美国国家健康研究所的美国国立生物技术信息中心序列数据库的责任序列数据库美国国立生物技术信息中心.得到的数据包括了从具有代表性的部分短基因序列到全基因组,蛋白质结构和基因障碍的临床描述。美国国立生物技术信息中心美国国立生物技术信息中心
表一。美国国立生物技术信息中心序列数据库
描述
数据库检索工具
数据库检索系统
进入公众可利用的核酸序列数据库医学文献检索服务与
分类浏览器
美国国立生物技术信息中心美国国立生物技术信息中心
位点链接
一个官方命名,别名
序列相似搜索程序家族
序列相似搜索程序
序列相似搜索程序家族(包括序列相似搜索程序, 位点特异性反复序列相似搜索程序, 模式发现迭代序列相似搜索程序, 双序列相似搜索程序) 在核酸序列数据库
基因水平序列资源
唯一人类基因序列
唯一人类基因序列序列数据库斑马鱼
同源基因
一个包含垂直同源的唯一人类基因序列数据库中的人、小鼠、大鼠、斑马鱼和牛基因
数据库的参考序列
提供了校正的序列数据和相关的信息,给同行提供mRNA和蛋白质使用的标准
单核苷多态性数据库不仅包括单核苷酸替代,而且包括短核苷酸的删除与插入多态性,这些都被科学共同体保存。
开放阅读框寻觅器
电子
通过与序列标签位点数据库中的序列和引物对比来确定序列标签位点在一段核苷酸序列上的位置的工具。
染色体序列资源
人类图谱浏览器
基因组浏览器展现了人类基因组图谱的全貌,包括物理图谱和基因图谱。
人类基因组序列
由人类基因组计划序列中心保存的能提供人类基因组序列资料,比如个人基因组构成的程序。
人类基因标记的物理图谱
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人类/小鼠同源图
能够在来自于人和鼠的同源DNA片段上获得遗传基因的位置图谱。
基因组刻度分析资源
基因组检索系统
基因组检索系统数据库组织和提供有利于超过900种生物物种的基因组测序与绘图的软件。
蛋白相邻类的聚簇
蛋白相邻类的聚簇
基因表达与表现型形式分析资源
癌症基因组剖析计划
基因表达汇编
利用一系列实验技术如,基因芯片和基因表达的连续分析,获得的基因表达资料的数据库。
基因表达的连续分析图谱
基因表达的连续分析图谱可以提供许多由基因表达的连续分析技术产生的资料的分析功能。
在线人类孟德尔遗传
人类基因目录,是由Dr Victor A. McKusick和他在霍普金斯的同事撰写和编辑的。
分子的结构
保守结构域数据库
保守结构域数据库收集了来自简单分子结构搜索工具和同源蛋白结构域数据库,以位点特异性反复序列相似搜索程序文库的形式包含了每一个保守的结构域,的资料。这个库可以用反向位点特异性序列相似搜索程序找到。
三维蛋白质结构的分子模型数据库
三维蛋白质结构的分子模型数据库
数据库检索工具
数据库检索系统是一个完整的检索系统,通过他可以查询脱氧核糖核苷酸与蛋白质序列,基因组图谱,人口趋势,通过三维蛋白质结构的分子模型数据库美国国立生物技术信息中心序列数据库美国国立生物技术信息中心79 000种生物做索引。分类浏览器可被用于浏览分类的位置或检索序列和特殊生物或者生物组的结构数据。美国国立生物技术信息中心国立生物技术信息中心美国国立生物技术信息中心提供一个单一查询界面来找到某一个遗传位点的序列和描述性信息美国国立生物技术信息中心blast@.。你可以通过发送单词帮助到服务器地址来获得你想要的文献。
唯一基因序列集合
为了管理数量大而资讯含量少的表达序列标签,美国国立生物技术信息中心斑马鱼84 000个序列基因簇。同样的,大老鼠,小老鼠,斑马鱼73 000, 37 000, 10 000,和 5500簇。唯一人类基因序列集合收集的数据成为构建人类基因图谱的有效资源。基因的3’端非翻译区段和表达序列标签被转变成序列标签位点,然后在物理图谱上定位和插入基因图谱上已经存在的基因里。唯一人类基因序列集合收集的数据还可以被用做大规模基因表达研究的加工的唯一基因信息的来源。唯一基因序列集合每周用新的表达序列标签更新一次,每两个用新的特征序列更新一次。唯一基因序列集合簇有很多搜索方法,通过基因名,在染色体上的位置,cDNA文库,文献登记数和通用词。基因簇序列也可以从FTP
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