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科技信息 ○科教前沿○ SCIENCE TECHNOLOGY INFORMATION 2009 年 第33 期
基于小波分析的蛋白质序列分形研究
汤丽华
（南京邮电大学地理与生物信息学院 江苏 南京 210003 ）
摘 要 利用氨基酸的疏水自由能对蛋白质序列进行编码 选择墨西哥帽小波对于编码序列进行多尺度分解 应用基于小波分解的
【 】 ， ， Abry-
算法来研究蛋白质一级结构的分形特性 最后通过计算 指数来定量刻画蛋白质序列的自相似性 实验结果表明 本文的方法只依
Veitch ， Hurst 。 ，
据蛋白质一级序列的信息 可获得反映了蛋白质序列排列的自相似性和复杂度一个判据 相比于其他方法 本文的方法简单 可靠 为蛋白质序
， ， ， 、 ，
列的分析和研究提供了一个新的思路。
关键词 算法 指数 墨西哥帽小波 分形
【 】 ； ； ；
Abry-Veitch Hurst
号各个尺度层次上的影像 因而在本文中我们利用基于小波分析的
0.引言 。
[6]
算法 对于蛋白质编码序列进行 指数估计。
蛋白质是由氨基酸组成的肽链以一定的空间结构形成的 氨基酸 Abry-Veitch H
。
[7]
算法描述如下 给定一序列 对其进
的排列次序构成蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构决定了蛋白质 Abry-Veitch ： X ,i=1,2,3, ……n,
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