Pharmacophore Modeling and in Silico Screening Studies to Design Potential KDR Kinase Inhibitors.pdfVIP

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2015-09-04 发布于湖北
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Pharmacophore Modeling and in Silico Screening Studies to Design Potential KDR Kinase Inhibitors.pdf

FULLPAPER PharmacophoreModelingandinSilicoScreeningStudiesto DesignPotentialKDR KinaseInhibitors xu，Dan(徐丹) Sun，Haopeng(孙昊鹏) Chen，Yadong。(陈亚东) Sun，Liping (孙丽萍) You，Qidong，。(尤启冬) DepartmentofMedicinalChemistry，ChinaPharmaceuticalUniversity，Nanjing，Jiangsu210009，China SchoolofPharmacy，ChinaPharmaceuticalUniversiyt，Nanjing，Jiangs“210009，Chinn A novelligand—basedpharmacophoremodelforKDRkinasewasgeneratedonthebasisofchemicalfeaturesof 30KDRkinaseinhibitors．Thispharmacophoremodelconsistsofonehydrogen—bondacceptoronehyrdogen—bond , donorandtwohyrdophobicgroups．Severalmehtodshavebeenusedtovalidatethemodel ， suggestinghtatitcan serveasareliabletoo1forvirtualscreeningtofacilitatethediscoveryofnovelKDRinhibitors ． Themodelwasthen usedasdatabasesearchquery from hteNationalCancerInstitute(NCI)databaseofrtherationaldesigntoidentify new hitcompound． Keywords anticancer，KDRkinaseinhibitor,molecularmodeling virtualscreening ， Introduction In orderto gain furtherinsightinto the structural requirementsofKDR inhibitorsofrdurgdesign．anovel vascularendothelialgrowthfactor(VEGF1isapo— ligand—basedpharmacophoremodelwasdevelopedand tentmitogen produced by cellsthat s