日本血吸虫尼克酰胺磷酸核糖转移酶的生物信息学分析.pdfVIP

· 292 · 中国血吸虫病防治杂志 2011年第23卷第3期 ChinJSchistoControl201l，Vo1．23，No．3 [文章编号] 1005—6661(2011)03 292一o4 · 论著 · 日本血吸虫尼克酰胺磷酸核糖转移酶的 生物信息学分析 葛军 ，一，陈红根 ，胡薇 [摘要] 目的 对 日本血吸虫尼克酰胺磷酸核糖转移酶(SjNAMPT)基因序列及蛋白序列进行生物信息学分析，为该基因 的克隆表达和开发应用奠定基础。方法 利用Internet在线分析程序和相关工具软件分析SjNAMPT基因的开放阅读框， 分析基因编码蛋白的理化性质、结构域，并预测其空间结构和功能。结果 SjNAMPT蛋白由179个氨基酸组成，分子量为 19．63kDa，理论等电点为7．64，为稳定性蛋白，无跨膜区和螺旋卷曲结构 ，不含有信号肽 ，含有多个磷酸化位点，该蛋白属 于磷酸核糖转移酶保守结构域家族 ，亚细胞定位于细胞质，二级结构以无规卷曲为主，SjNAMPT蛋白序列与其他物种同种 蛋白序列相似性较低。结论 SjNAMPT蛋白为 日本血吸虫特异性蛋白，具有一定酶活性 ，可能与 日本血吸虫嘌呤代谢和 糖代谢有关，值得进一步研究。 [关键词】 日本血吸虫；尼克酰胺磷酸核糖转移酶；生物信息学；疫苗 [中图分类号】 R383．24 [文献标识码] A Bioinformaticsanalysisofnicotinamideph0sph0rib0syltransferaseofSchisto— somajapontcum GeJun ，ChenHong-gen ，HuWei 1SchooloflfieSciences，NanchangUniversity，Nanchang330046，China；2JiangxiProvincialInstituteofParasiticDiseases，Chi— na；3NationalInstituteofParasiticDiseases，ChineseCenterforDsieaseControlandPrevention，hCina Correspondingauthor [Abstract] Objective ToperformthebioinformaticsanalysisofnicotinamidephosphoribosyltransferaseofSchistosomajaponi— cum soastoprovidetheevidenceforthedevelopmentandapplicationofit．Methods Internetonlineproceduresandtherelated softwarewereexploitedtoanalyzetheopenreadingframe(ORF)ofSjNAMPTgene，physicalandchemicalpropertiesofSjNAMPT proteinandthedomainsoftheprotein，andpredictthespacestructureandfunctionsoftheprotein．Results TheSjNAMPTpro— teinsequencewascomposedof179aminoacidswith19．63kDaofthemolecularweight．Theproteinwasstableandhadnostruc— turesoftransmembraneandhelicalcoils．Theproteinbelongedtothefamilyofnicotinatephosphoribosyltransferasewithmultiple phosphorylationsites．Theproteinprobablylocatedincytoplasm anddominatedbyrandom coilsinsecondstructure．Thesimilarity oftheSjNAMPTproteinsequencewaslowerthanthatofotherspeci