基于耦合双向聚类技术的DLBCL异质性分析.pdf

遗 传HEREDITAS (Beijing) 28(9): 1129~1134, 2006 技术与方法 基于耦合双向聚类技术的DLBCL 异质性分析 1, 2 2~5 1 2, 3 3 3 3, 6 , , , , , , 同济大学医学遗传研究所 上海 同济大学生命科学技术学院 上海 哈尔滨医科大学生物信息学系 哈尔滨 (1. , 200092; 2. , 200092; 3. , 150086; 哈尔滨工业大学计算机学院 哈尔滨 首都医科大学生物医学工程学院 北京 4. , 150001; 5. , 100054; 6. Departments of Cardiovascular Medicine and Molecular Cardiology, Cleveland Clinic Foundation, Cleveland, Ohio 44195, USA) 摘 要: 基因芯片技术为疾病异质性研究提供了有力的工具 当前基于传统聚类分析的方法一般利用芯片上大量基 , 因作为特征来发现疾病的亚型 因此它们没有考虑到特征中包含的大量无关基因会掩盖有意义的疾病样本的分割 , (Heterogeneous Analysis Based on Coupled Two-Way 为了避免这个缺点 提出了基于耦合双向聚类的异质性分析方法 Clustering, HCTWC)来搜索有意义的基因簇以便发现样本的内在分割 B 该方法被应用于弥漫性大 细胞淋巴瘤 (diffuse large B-cell lymphoma DLBCL) , DLBCL 芯片数据集 通过识别的基因簇作为特征对 样本聚类发现生存期分别 为55%和25% 的两类DLBCL 亚型(P0.05), 因此, HCTWC 方法在解决疾病异质性是有效的 关键词 ; ; ; : 基因表达谱 疾病异质性 超顺磁性聚类 概念一致性 中图分类号: R394