基于DNA计算的遗传算法解决最小生成树问题.pdf

第15卷第2期 鄂州 大学学报 2008年3月 JournalofEzhou Mar．20()8 V01．15No．2 University 基于DNA计算的遗传算法解决最小生成树问题 韩世芬 (鄂州大学计算机系，湖北鄂州436000) 摘要：给出了最小生成树问题(MST)的一个基于混合DNA计算的遗传算法模型。在该模型中，为了 对最小生成树的解进行编码和解码．通过引A．DNA计算，提出了一种最小生成树问题的改进遗传算法编 码方案，该方案吸收了DNA计算和遗传算法的优点，具有固定的长度。-为了搜索需要的最佳编码，引入遗 传算法搜索技术。并给出了自适应的交叉算子和变异算子。最后，根据最小生成树问题的特点，通过实例仿 真验证了所提出的基于DNA计算的遗传算法的有效性。 关键词：DNA计算；遗传算法；最小生成树 中图分类号：TP319 文献标识码：A 1引言 以解决最小生成树问题。 最小生成树问题(MinimumTree， 2问题的描述及模型 Spanning MST)在组合优化中具有悠久的历史。许多网络优 考虑连通图G=(V，E)，其中边V= 化问题．如通信网设计、渠道铺设及VISI、多播主 干网等网络拓扑结构设计问题。首先都归结于该 问题。在这些应用中，为了规划合理的传输网络， 有必要限定连接到节点的边的数量，即度约束最 表距离、价格等，其中WiI0，1≤i≤m。生成树是连 小生成树问题。所谓的度约束最小生成树问题就 接y中所有顶点的来自E的最小边集。因此对于图 是要在已知网络中求一棵连接着所有网络节点且 G至少可以找到一颗生成树。记为难(y；E(T))；E 花费(其中网络节点之间的连接可以代表节点之 间的传输距离、线路的质量或者网络延迟，以下统 (T)C_E，称乞W。是r的权。最小生成树f．q题就是在 ‘∈e(n 称为花费)最小的一棵树，且该树的各个节点的度 图G的生成树r中寻找那些具有权值最小的生成 均不超过一个给定的约束。它是NP难问题。在许多 树。 领域都有重要的实际应用价值。近年来，为解决该 3最小生成树问题的改进遗传算法编码 问题，提出了一些新的算法。 3．1混合DNA计算的遗传算法编码 DNA计算是一种以DNA及相关的某些生物酶 在最小生成树问题的遗传算法编码中，包括 作为最基本材料的、基于某些生化反应原理的一 顶点编码和边的编码。其中边的编码根据顶点的 种新型的分子生物计算方法。DNA计算的基本思 编码给出。 想是：利HJDNA特殊的双螺旋结构和碱基互补配 混合DNA计算的遗传编码算法过程如下： 对规律进行信息编码，把要运算的对象映射成 (1)随机构造顶点的位置序列； DNA分子链。在生物酶的作用下，生成各种数据池 (datap001)．然后按照一定的规则将原始问题的数 基互补配对规则给出边的连接序； 据运算高度并行地映射成DNA分子链的可控的生 (3)随机产生边的权值序列； 化过程-21。 (4)当代数g≤g。，循环： 本文提出一种混合DNA计算的遗传算法，用 a)计算每个编码的适应度； 收稿日期：2007—10—31 作者简介：韩世芬(1973一)，女，湖北鄂州入，鄂州大学计算机系讲师，硕士。研究方向：智能计算。 万方数据 第2期 韩世芬：基于DNA计算的遗传算法解决最小