玉米叶片中甘蔗花叶病毒检测及其基因组3＇端序列分析.pdfVIP

湖南农业科学 2011，(11)：8-10 HunanAgriculturalSciences 玉米叶片中甘蔗花叶病毒检测及其基因组3。端序列分析 龚海燕 一，朱水芳 ，张永江 ，杨 碧 ，高必达 (1．湖南农业大学，湖南 长沙 410128；2．中国检验检疫科学研究院， 北京 100029；3．云南出入境检验检疫局，云南 昆明 650228) 摘 要：在云南元谋采集的玉米叶片样品上获得一病毒分离物，经生物学(摩擦接种)、血清学(DAS—EusA)和分子生物学(RT— PCR)鉴定，确定为甘蔗花叶病毒(SugarcaneMosaicVirus，SCMV)。为分析其基因组 3端特性，以叶片中提取的总RNA为模板，对 基因组 3端进行RT—PCR扩增，产物克隆到pMD18-T载体上进行序列分析。结果表明，SCMV基因组 3端序列包含了非编码区 254个碱基和编码蛋白的l578个碱基。运用Mega4．1构建进化树 ，系统进化树表明，除SCMV—Spain2外，其余分离物可明显的划 分为2个群体 ：第 1群体包括分离物 SCMV—SHANDONG，SCMV—SHANXI与SCMV—HENAN；第 Ⅱ群体包括SCMV—Mexico和 SCMV—Spainl。直观地看，SCMV分离物之间的系统进化关系和地理分布有一定的联系，SCMV—SHANDONG与SCMV—HENEN分 离物关系很近，而 SCMV云南分离物距离相对较远。其原因可能是云南分离物与中国其他地区分离物具有一个距今较近的共同 祖先。 ． 关键词：玉米；甘蔗花叶病毒；检测；3末端序列 中图分类号：$513 文献标识码：A 文章编号：1006—060X(2011)l1-0008～03 DetectionofSugarcaneM osaicVirusinM aizeandAnalysisof 3TerminalSequence0fItsGenome GONGHai—yan’，ZHUShui—fang，ZHANGYong-jiang，YANGBi。，GAOBi—da’ (1．HunanAgriculturalUniversity,Changsha410128,PRC；2．ChineseAcademyofInspectionandQuarantine， Beijing]00029,PRC；3．YunnanEntry—ExitInspectoinnadQuarnatineBureau，Kunming650228,PRC) Abstract：Avirusisolatewasobtainedfrom themaizeleavessamplecollectedrfom YuanmouofYunnan，whichWas identifieda8sugarcanemosaicvirus(SCMV)bybiologicalmethod(mechanicalinoculation)，sewlo~ealmethod(DAS- ELISA)andmolecularbiologicalmethod (RT—PCR)．Toanalyzethefeaturesof3terminalsequenceofSCMVgenome， takingtotalRNA extractedfrom maizeleavesastemplatetoamplifythe3temr inalsequenceofSCMV genomebyRT- PCR。thenhteproductswereclonedintopMD18-T vectorforsequenceanalysis．Theresultsshowedthatthe3temr inal sequencesofSCMV genomecontains254bpbasesof5UTR and1578basesofencodedprotein．Thephylogenetictre