广州地区HCMV临床病毒株UL137基因的结构特征与多态性.pdfVIP

No．3 第29卷第3期 aotl．t大学学报(医学科学版) Vol-29 OFSUNYAT-SEN Mav2008 2008年5月 JOURNAL UNIVERSITY(MEDICALSCIENCES) 广州地区HCMV临床病毒株ULl37基因的结构 特征与多态性 王波1，李月琴z，胡兢晶1，苏海浩1，何震宇2，田传军z，张纯青3，叶铁真3，周天鸿： (1．广东省妇幼保健院儿科，广东广州510010；2．暨南大学生命科学院．广东广州510632； 3．广州呼吸疾病研究所国家重点实验室，广东广州510120) 摘要：【目的】研究广州地区新生儿感染人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离株ULl37基因的结构 特征与基因多态性。【方法】从62份被证实为临床HCMV感染的新生儿尿液标本中分离获得3株低传代临 床病毒株，经多重PCR鉴定后分别命名为HCMVD2、D3和D52。对3株临床分离株进行HCMVULl37基因 全序列PCR扩增，PCR产物纯化后进行基因克隆，构建HCMV ULl37一pMDl8一T重组质粒；基因测序；将 HCMV ULl37基因序列呈报GenBank，并进行基因生物信息学分析。【结果】成功从广州地区新生儿感染 HCMV患儿体内分离3株HCMV临床病毒株。克隆测序后呈报GenBank并被收录．收录序列号分别为： 源性在96．91％一100％之间，其变异均为碱基替换；编码蛋白均由96个氨基酸残基组成，同源性在90．63％一 100％之间，超半数的变异发生在第6l～81位氨基酸残基之间；编码蛋白翻译后修饰位点包括PKS、MYS、 l1．50—12．00之间，呈强碱性。【结论】广州地区临床低传代分离株HCMVULl37基因核苷酸序列及其编码蛋 ULl37 白的氨基酸序列极为保守。但仍存在一定多态性。提示HCMV ORF可能是一个具有重要功能的基因。 关键词：人巨细胞病毒；临床病毒株；低传代；ULl37；基因序列；基因多态性 中图分类号：R37 文献标识码：A 文章编号：1672—3554(2008)03—0264—06 of CharacterizationHuman Gene in ClinicalIsolatesin Low-passage Guangzhou WANG TIAN B01，LI Yue·qin92，HUJing-jin91，SUHai—ha01，HEZhen-yU2Chuan—jun2， ZHANG Chun—qin93，YETie—zhen3，ZHOUTian—hon92 of WomenandChildren ofLife (1．DepartmentPediatrics，Guangdong Hospital，Guangzhou510010；2．College and 51 Science Instituteof Technology，JinanUniver