渗透剂稳定蛋白质结构分子动力学模拟研究.pdfVIP

中文摘要 只有正确折叠的蛋白质分子才能具有生物活性；因此在蛋白质工程和临床医 学中，必须保证目标蛋白质处于合适的构象。渗透剂对蛋白质结构有着独特的稳 定作用，因此被广泛应用于人工稳定和复性蛋白质技术中，其稳定机理也成为了 生物技术领域中研究的热点。之前有研究发现渗透剂对蛋白质的稳定能力与它的 分子表面的极性基团表面积比例呈反比关系，但忽略了分子体积所代表的空间位 阻效应的影响，因此存在一定误差。我们推测分子体积也是影响渗透剂稳定作用 的因素，对之前的理论进行了修正和发展，对于优化实验和生产条件、理性设计 新型添加剂和配基，具有重要的指导意义。 本研究利用了计算机模拟的优势，以C12为模型蛋白，通过分子动力学模拟 考察8种典型渗透剂对C12的热稳定性的影响；研究核心是根据模拟数据，利用 统计学双参数拟合模型同时分析分子体积和极性基团表面积比例与渗透剂稳定 能力的关系，加深了渗透剂稳定能力的影响因素的理性认识。之后将模型结果与 具体的模拟数据分析手段结合，进一步的分析了多元醇类渗透剂与蛋白质作用的 分子机理，阐述了造成多元醇类渗透剂独特性质的原因。 研究首先发现渗透剂对C12有着不同程度的稳定能力；之后定义并计算了能 够综合描述C12结构特性的一维参数，从量化的角度定义了