顺式作用元件地预测.pdfVIP

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MedMot 医学分子生物学杂志,2006,3(3):241-244j Biol,2006,3(3):241-24J4 顺式作用元件的预测 武会娟1,-,成军1,罗军2,张丽娟1 1 1北京地坛医院传染病研究所北京市,10001 2西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌,712100 【摘要】 顺式作用元件是同~DNA分子中具有特殊功能的转录因子DNA结合位点和其它调控基序,在 基因转录起始调控中起重要作用;按功能特性分为通用调节元件如启动子、增强子及沉默子和专一性元件 如激素反应元件,cAMP反应元件;确定顺式作用元件的试验方法主要有:DNA结构分析、序列分析和基 因删除或替换等,软件预测是确定顺式作用元件的另一种方法,但不同软件预测结果差异较大,将试验方 法与软件预测相结合能够提高顺式作用元件预测的准确性。 【关键词】 顺式作用元件;DNA结构分析;序列分析;预测软件 【中图分类号】 R34 Predictionof Elements cis-ActingRegulatory WU Junl,LUOJun2,ZAHNG Hutjuanl一,CHENG Lijuanl 7 Institute Ditan ofInfectionsDiseases,BettingHospital,Beijing,100011,China 2 The AnimalScienceand and University,Yah— Collegeof Technology,NorthwestAgricultureForestry gling,Shanxi,712100,China elementssuchas 【Abstract】Cis-actingregulatoryelements,includinggeneralregulatory pro— andsilencerand elementssuchascAMP moter.enhancer specialresponse responseelements,hor— in mone elements.are functionalshortDNA locatedthesame response specifically sequence gene. been in elements Overthe has made decades,muchprogress predictingcis-actingregulatory by past methods:DNAstructureand deletion experimental sequenceanalysis,DNAmutagenesis,andpre- thetwomethodshavesome useofthemcould diction limitations,combination software.Ahhough the in elementsofunknownDNA enhance efficiencyfi

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