分子生物学实验诊断技术(论文资料).pdfVIP

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中国试剂网 3.9.148 分子生物学实验诊断技术 一、酸杂交技术 检验方法建立的基本要素是特异性和灵敏度,在复杂的物体中,使无法感觉的特 定物质进入人类的观察范围。核酸杂交检测技术就是利用核酸碱基严格配对的特 异性,核酸标记物的灵敏度而建立的检测核酸结构与功能的方法。该法建立以来 已有二十年,目前研究实验室用得多,临床实验室用得较少,除成本高外,关键 是操作复杂,重复性差,仅能半定量。成本高可随经济发展而缓和,但其它缺点 尚需努力克服。 杂交实验的探针应具有特异性,对应不同的杂交方法靶基因(被检基因)应有一 定的纯度与丰度。杂交反应的开始是碰撞,探针浓度高则速率增加,一般 32P 标记探记探针5-100ng/ml,非放射性探针25-1000ng/ml ,原位杂交无论放射还是 非放射物标记,一般都需0.1-5.0 μg/ml 。当探针过量时,杂交速率取决于探针长 度,如一个100ng/ml20 个核苷酸的合成寡核苷酸探针与1-100pg 1kb 长的靶基因 杂交,10 分钟能达到最大杂交率。而相同条件下2kb 的克隆探针需160 小时。 主要原因是这里所指浓度是重量浓度而非摩尔浓度。长探针因标记量大,小的摩 尔浓度已足以达到需要的检测灵敏度。为了促进长探针 (>250 个核苷酸)的杂 交速率,加入杂交促进剂是非常必要的。最常用的是硫酸葡聚糖,使用浓度为5 %-10 %,浓度过高会增加杂交液粘度。聚乙二醇也作为促进剂,价廉且粘度低, 但检测本底太高。另外杂交的温度、盐浓度、甲酰胺浓度可调节杂交分子形成的 稳定性。理论选用DNA :DNA 杂交温度T =Tm -25 ℃,此时杂交分子最易形成。 但具体实验中影响Tm 值的因素很多,一般杂交温度低,形成的杂交分子较稳定。 RNA :DNA 杂交分子的Tm 大 10-15℃,RNA :RNA 杂交分子的Tm 大20-25 ℃,使得杂交温度提高,此时需调节甲酰胺浓度来调节杂交温度。好的实验条件 最终应在实践中摸索建立。 (一) 点杂交 用探针进行杂交。尼龙膜,特别是聚偏氟乙烯膜 (PVDF )与DNA 结合力更高, 坚韧、易操作。点样可手工,也可用真空点样品。检测可用放射性探针自显影或 非放射性探针显色。可用于DNA 或RNA 分析。下面以非放射性探针分析DNA 为例,结果是显色。 中国试剂网 3.9.147 取硝酸纤维素膜和滤纸在2xSSC(NaCl 300mmol/L,柠檬酸钠30mmol/L),pH7.0 浸 15 分钟,平铺滤纸在点样抽滤器上,再铺上硝酸纤维滤膜,真空抽气使点样 器减压,膜显出凹面。点样50 μl (5-10 μgDNA,可直接点血清样品)于凹面, 撤去真空,把膜晾干。取滤纸浸0.5mol/L NaOH,1.0mol/L NaCl,把膜平铺于滤 纸上20 分钟,变性。取滤纸二张分别浸在0.5mol/L Tris-Hcl pH7.5 和 1.0mol/L Tris-HCl,0.6mol/L NaCl pH7.5,分别依次把膜平铺于滤纸上,各中和15 分钟, 中和后膜的pH 为7.2-7.5 。于80℃,30-45 分钟烘干。(RNA 分析点样缓冲液系 统不同,无需变性,中和,余大致相同)用塑料封口机把膜和2.5ml 预杂交缓冲 液封入塑料袋中,42 ℃,水浴30 分钟。 探针2ml (50-100ng/2ml 预杂交缓冲液)于100℃,10 分钟,马上置冰浴5 分钟 (变性)。加入袋封口。42 ℃水浴过夜。去杂交液 (可回收)。以 2xSSC ,0.1 % SDS15ml,50℃5 分钟洗二次。0.1SSC,0.1 %SDS 洗二次。封闭:另取袋封入膜 和封闭液(蛋白质50mg/ml,100mmol/L Tris-HCl(pH7.5)/150mmol/L NaCl)2.5ml , 37℃

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