第一章生物信息学绪论.pptVIP

Protein Machines * * 生物信息学研究内容 功能数据库 DNA序列的组装 将片断组装成完整的DNA序列 四、生物信息学的展望 * (uncoding regions, 95% of human genome) One of the largest challenges is identifying the unknown functions that almost certainly exist in much of the “junk” DNA. * * * 张世华 Bioinfo_ahau@ 密码：ahau_0551 第一章 生物信息学绪论 生物信息学的定义 一 生物信息学的兴起 二 生物信息学展望 三 4 四 生物信息学的研究对象及内容 一、生物信息学的定义 生物信息学（Bioinformatics）的来源 ?Dr. Hwa A. Lim （林华安）1987年提出 “Bio-informatique” → “Bioinformatics” ?林华安最近又将Biothechnology、Information结合纳米科技（Nano），提出 Binformatics（生纳信息学）。 ? 生物物理学，生物化学，计算数学，生物统计学等等。 生物信息学之父 ——林华安 What is bioinformatics ? 生物信息学： 存储、修复、分析、整合生物数据的学科 分子生物学与信息技术的结合体 研究材料与结果：各种生物学数据 研究工具：网络、计算机 包括生物学和计算两部分 现代生物研究的核心 首先，该学科仍然是一门处于高速发展的学科，学科知识每天都在发生着细微的变化，这样使得科学家难以给出一个长久不被动摇的定义； 另一方面，生物信息学是一门多学科交叉的新生学科，不同学科的科学家对生物信息学有着不同的侧重点，给出的定义也有不同的局限性，且这种学科的交叉极有可能会随着生物信息学发展的需要而进一步升级。 目前为止，尚没有一个标准定义？ 美国国家卫生研究院（NIH）的定义： Bioinformatics (Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data, including those to acquire, store, organize, archive, analyze, or visualize such data.) 为拓展生物学、医学、行为学和卫生学数据的用途而进行有关计算机方法手段的研究、开发与应用，包括此类数据的采集、存贮、整理、归档、分析与可视化。 What is Bioinformatics? What is Bioinformatics? 生物信息学 是采用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列等各种生物信息的采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学，是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学和化学等相互渗透而形成的交叉学科。 对生物信息学定义的归纳 二、生物信息学的兴起 Isaac Newton 牛 顿 Johannes Kepler 开普勒 Tycho Brahe 第 谷 第一次科学浪潮 天象观测 ? 大量数据 ? 行星运动定律 ? 万有引力定律 ? 航空航天技术 元素与大量化合物 ? 元素周期表 ? 现代化学化工 第二次科学浪潮 Dmitri Mendeleev 门捷列夫 大量原子光谱数据 ? 量子论 ? 量子力学 ? 信息技术 Max Karl Ernst Ludwig Planck 普朗克 Albert Einstein 爱因斯坦 Niels Bohr 玻尔 Erwin Schr?dinger 薛定谔 第三次科学浪潮 … … … 基因组超大量的序列和结构数据 ? ？重大的发现 第四次科学浪潮？ 从人类基因组计划（HGP）说起 曼哈顿原子弹计划 （1942-46） 阿波罗登月计划 (1961-69) 人类基因组计划 (1990-2003) HGP的最初目标通过国际合作，用15年时间(1990～2005)至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其它模式生物进行类似研究。 4张图：遗传图 物理图 序列图