杨树ESTSSR标记的开发.pdf

第45卷第9期 林 业 科 学 V01．45．No．9 2009年9月 SCIENTIASILVAESINICAE Sep．，2009 杨树EST—SSR标记的开发* 张新叶1 宋丛文1 张亚东1 杨彦伶1 黄敏仁2 (1．湖北省林业科学研究院武汉430079；2．南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室南京210037) 摘 要： 利用来自美洲黑杨及欧美杨的20 行序列拼接，然后在非重复序列中发现由二核苷酸至五核苷酸组成的SSR重复序列。共在10816个非重复序列中 发现l604个序列含有SSR，占总非重复序列的14．8％。在发现的1918个SSR重复序列中，二核苷酸重复是最丰富 的重复类型，占总类型的62．3％。设计合成48对SSR引物，利用6个不同的杨树品种对其进行验证。结果约90％ 的引物获得扩增产物，58％的引物在6个不同杨树品种中产生多态性分离。另外，还对重复序列的数量及重复类型 进行了讨论。 关键词： 杨树；表达序列标签(EST)；简单重复序列(SSR) 中图分类号：$718．46 文献标识码：A 文章编号：1001—7488(2009}09—0053—07 ofEST．SSRin deltoidesandP．euramericana Development Populus Minren2 ZhangXinyelSongCongwenlZhangYadon91YangYardin91Huang Wuhan Geneticsand＆M (1．HubeiForestryAcademy430079；2．KeyLaborato吖ofForest Engineering，Na,{iingForestryUniversityNanjing210037) Abstract：Plant model and are ina genomicsprojectsinvolvingspeciesmanyagriculturallyimportantcropsresultingrapidly database of and DNA collectionof increasing genomie sequences．nebig sequence expressed expressed isavailablein offersan to ESTs Populusspecies database，and public opponunit)ridentifysimplesequencerepeats(SSR)inby data allestimateof inthe ofthe and beusefulfor mining．Thesesequencesmayprovide diversityexpressedportiongenomemay for of traitsofinterest，andadditional comparativemapping，fo