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论文集 【8】贾志海，王培等．不同放牧方式对草地和绵羊生产性能的影响．[J】．中国草地，1990：(3)34—38． 【9】贾志海，王培等．不同放牧方式对草地和绵羊生产性能的影响[M】．中国农业科技出版社，1990，90-95． 【10】刘永志．内蒙古草地营养物质含量动态的研究[J】．中国草地，1993：16—20． 【11】田富洋．李晋阳．李法德．等．反刍动物采食量测定方法的研究进展[J】．中国畜牧杂志，2006：(9)． [12】肖金玉．侯扶江．于应文．等．链烷技术估测放牧动物牧草采食置与消化率【J】．草业学报．2005．14：125_130． R I啪F W ME．TalI rie to and [13]Gil I inL，McCoI T．KenethT。Hodges grassprairesponse grazingsystemst∞king of rate[J】．JournaIRange№nage，1998，(51)：139-2∞． 【14]程渡，崔鲜一，彭玉梅．天然针茅草地生物量与营养动态的研究[J]．内蒙古草业。2004．16(2)：16—18． 【15】赵万羽．李瑞年．天山北坡中段季节牧场利用期牧草营养动态研究(2000增刊)：42-46． [16】杨静．两种放牧制度下的牧草营养价值及绵羊对营养的摄食[J】．内蒙古畜牧科学，2∞1，(6)：7—8． 系统水平的分析细小病毒与疾病之间的关系 常志强，崔尚金 (黑龙江省哈尔滨兽医研究所哈尔滨150001) 摘要：病毒入侵人体后主要先与细胞结合，机体细胞或组织生成反应，结果会引发各种疾病，为了 清楚的体现这一过程，我们运用文本挖掘技术，从文献中挖掘四部分数据。首先是提取与细小病毒 有关的疾病数据，这一目的是为了寻找出细小病毒入侵人体后的直接作用结果；然后提取细小病毒 与机体细胞或组织共出现的数据，这一数据是考察细小病毒引起人体疾病所入侵的不同部位；第三 步是提取人体疾病与组织的关联性，从而将疾病与组织特异性联系起来；最后是寻找出细小病毒、 组织(活细胞)和疾病三者之间的关联。 1材料和方法 本文在系统水平上，首先用文本挖掘技术从文献中挖掘人类细小病毒有关的基因，运用统计学 富集方法对基凶进行功能富集，考察与细小病毒有关的基区|所参与的生物学过程和通路，考察这些 基凶所富集的疾病类型，并建立病毒一基因一疾病双层网络；然后从文献中提取细小病毒入侵的组织 (细胞)，与细小病毒有关的疾病，以及这些疾病与组织之间的关联，运用概率模型构建细小病毒一 组织(细胞)一疾病双层网络。 1．1数据获取 212 中硐葺牧辫医学会信息技术分会2011年学术研讨会 基凶列表。由于基凶列表中，有很多基因名词并不能真正的表示牛物学意义的基凶，如“uniGene-ID： 所有XML格式的文献信息中解析出摘要和PMID。 NLP(Nature Language Process)技术的发展使得我们能够从大量的文献中提取细小病毒 基凶，挖掘与细小病毒有关的疾病和组织(细胞)信息，并从文献中提取相关疾病和组织(细胞) 的关联关系。基于共出现的方法挖掘关系基于下列假设，在已报道的句予中，如果基因A与细小病 毒共出现的次数大于某个阈值，则认为基因A与细小病毒有关。在这种假设下，我们认为所有与细 小病毒共出现次数大于等于3的基因作为与细小病毒有关的基因。 运用文本挖掘技术挖掘关系的流程见图1。 1．2功能富集 Gene Ont0109y(GO)数据库存储了细胞组分，生物学过程，分子功能这三个条目，涵盖了当 前大部分基因的功能注释信息，数据本身是有层次结构的，同时注释到底层的功能包含的基因更加 显著的与该功能有关，基于这个原理，我们运用超几何方法，对从文献中得到的人类基因在GO数据 库中生物学功能的第五层进行富集，考察与细小病毒有关的基凶所参与的生物学过程。 1．3通路富集 Bioc