TLR9配体结合域多参数综合分析.pdfVIP

免 疫 学 杂 志 　第 21 卷 　第 4 期 　2005 年 7 月 　　IMMUNOLOGICAL JOURNAL Vol . 21 No . 4 July 2005 ·292 · 　 ( ) [文章编号] 2005 TL R9 配体结合域的多参数综合分析 李元朝 , 吕凤林 (第三军医大学大坪医院野战外科研究所一室 ,重庆 400042) ( ) [摘 　要] 　目的　通过生物信息学的多参数评估 ,综合分析人 Toll 样受体第 9 型 TLR9 的配体结合域 。方法 　使用 HNN 二级结构分析 、ClustalW 序列比对以及 Goldkey 软件的亲水性 、可及性和表面电荷极性分析等多种手段对 TLR9 配体结合域进行 综合评估 。结果 　第 34～41 、51～60 、113～119 、429～448 和 453～471 位等 5 个区域满足各项指标 ,最可能是 TLR9 的配体结 合域 。结论 　本文的分析结果对人 TLR9 配体结合域的后继研究具有指导意义 。 [ 关键词] 　TLR9 ;配体结合域 ;多参数综合分析 [ 中图分类号] 　R392 　　　　[文献标识码] 　A Multipleparameter analysis of TL R9 binding domain L I Yuanchao , LV Fenglin ( State Key L aboratory of Trauma , B urns and Combined Inj ury , Dep artment 1, Institute of S urgery Research , Dap ing Hosp ital , Third Military Medical University , Chongqing 400042 , China) [Abstract] 　Objective 　To predict binding domains of toll like receptor 9 ( TLR9 ) though multiply parameter analysis. Me thods 　Based on the ClustalW sequence alignment , the parameters of secondary structure , hydrophilicity , accessibility , and charge distribution were assessed by using methods of HNN and Goldkey. Results 　Domains between 36 - 39 , 51 - 60 , 113 - 119 , 429 - 448 , and 453 - 471were most likely to be the binding domains of TLR9. Conclusion 　The possible binding domains of TLR9 are found , which may be the base for next laboratory work. [ Key words] 　TLR9 ; Binding domain ; Multiple parameter analysis 　　人 TLR9 ( Toll like receptor 9) 为人 Toll 样 受 1. 2 　TL R 氨基酸序列 　NCBI (National center for ( ) ) 体 Toll like receptors , TLRs 家族成员之一 ,介导机体 biotechnology information 最新收录的各 TLR 分子氨基 对细菌 DNA 之 Cp G 基序 、染色体IgG 复合物以及 Ⅱ