摘 要
最近的研究数据表明,白种人群的肥胖诊断标准可能不适用于亚
洲人。虽然在白种人群中已经开展了许多关于肥胖相关表型的全基因
组关联研究,但是在中国人群中至今没有成功运用全基因组关联研究
定位肥胖基因的报道。在统计遗传学领域,已有大量关于单个性状的
关联分析方法研究,但是对于两个相关性状的关联分析方法研究,还
少有开展。
本文首先使用全身脂肪含量(PBF)作为金标准,在1109个男性
个体和879个女性个体中采用受试者操作特征曲线(ROC)分析估计了
预测肥胖的能力。分析表明,BMI、WC、WHR都与PBF高度相关,相
关系数为0.45—0.75。真阳性率在男性中是82.4%到94.1%,在女
性中是68.8%到86.3%。真阴性率在男性中是64.1%到84.7%,在
女性中是56.9%到79.0%。BMI和wC两个指标在男性和女性不同年
标,wHR次之。该研究同时发现,用BMI在中国人群中预测肥胖的标
准要明显低于白种人群。
接下来我们在597个中国北方人群中运用Affymetrix500k芯片
开展了全基因组关联研究定位影响BMI变异的新基因,此研究进一步
在2955个中国南方人中进行了重复验证。通过一系列的质量控制程
序后,281,533个单核苷酸多态性(SNP)可以进行关联分析。经过
methyl
initiation
translation
q=O.033)。另外,位于EIF2AK4白ukaryotic
factor2 kinase rs4432245和
alpha 4)基因内的两个临近的SNP
q=O.048)。在南方人群的验证研究中,这两个位点与BMI的关联获
得了证实(p=O.03和0.01)。
除此之外,我们通过大量的计算机模拟,运用广义估计方程2
(GEE2)对两个相关性状的关联定位方法进行研究。通过与单个性状
关联研究的功效比较,发现双变量模型比单变量模型统计功效更高。
而且双变量关联分析的假阳性率与单变量分析相比没有差别,都在设
定的显著性水平O.05左右。所以我们提出的双变量分析模型是合理
的。进一步对肥胖和骨质疏松两个相关性状的实验数据进行的双变量
关联分析验证了该方法的优越性。
本研究的创新性在于:1)第一次在中国南方人群中对衡量全身
肥胖的简易指标进行评估;2)第一次在中国人群中运用全基因组关
联分析方法定位影响BMI变异的新基因;3)第一次尝试运用广义估
计方程2拟合基于群体设计的两个数量性状的关联定位研究。
关键词:肥胖;受试者操作特征曲线;BMI;全基因组关联;双变量
关联;广义估计方程
H
ABSTRACT
Recentdata thatcurrent
suggest obesitydiagnostic
criterionforCaucasiansnotbe forAsian
may appropriate
wideassociation have
studiesfor
populations.Genome obesity
been conductedinCaucassiansbutnonewasdone
successfully
inChinese.Intheareaofstatistical
have
association been
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