插入缺失（InDel）分子标记揭示亚洲栽培稻（Oryza+sativa+L.）籼—粳分化.pdfVIP

插入缺失(InDel)分子标记揭示的亚洲栽培稻 (Oryza．vativaL．)籼一粳分化 摘要 satJva 亚洲栽培稻(O矿yz,a L)是世界上最重要的粮食作物之一，在其一万多 年的栽培驯化过程中，因适应不同的农业生态环境，形成了丰富的遗传多样性和明显 离的生态类型。籼稻和粳稻在形态和分子水平上存在显著差异，亚种间杂交可产生巨 大的杂种优势，是超级杂交稻实现高产、稳产的根本途径之一。本文通过基于籼稻 93—11和粳稻日本晴全基因组DNA序列比对获得的差异片段设计的插入缺失(InDel) 分子标记的检测，结合主成分分析和聚类分析的方法分析了栽培稻品种之间的遗传分 化以及栽培稻和野生稻之间的亲缘关系，旨在探讨InDel分子标记在籼稻、粳稻品种 鉴定以及籼一粳分化研究中的应用价值。 选用45对分布于水稻12对染色体上的lnDel引物，对59份经过程氏六性状形态 指数法鉴定为典型籼稻(26份)和典型粳稻(33份)的DNA进行PCR扩增和电泳检 测。每对InDel引物都能检测到2～3个等位基因，以93一11电泳条带的位置为籼型 特异性条带位置，以日本晴电泳条带位置为粳型特异性条带位置，对