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- 2015-10-24 发布于贵州
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核磁共振代组学数据的尺度归一化和特征代谢物辨识新方法
摘 要
代谢组学方法是上世纪90年代中期发展起来的--I-J新学科,它借助高通量、高灵
敏度与高精确度的现代分析技术,分析细胞、组织和生物体液中内源性代谢物的整体组
成,并通过代谢物复杂的、动态的变化,辨识和解析被研究对象的生理病理状态。
高通量、高分辨的现代分析仪器在获取生物样品中更丰富、更准确的代谢信息的同
时,也给后续的数据分析带来了巨大的挑战。本文从数据预处理和特征选择两方面出发,
深入研究核磁共振代谢组学数据处理,提出新的数据归一化方法和特征选择方法,增强
后续数据统计分析的可靠性。本文工作包括如下两个创新点:
首先,提出一种有监督的数据尺度归一化方法。该方法不强调各变量之间的“尺度
归一,而是在原始数据的基础上,通过提高其中稳定性高、且在不同类别样本中具有显
著差异性的变量权重,以增强与特征代谢物相关的信息。采用模拟数据和真实代谢组学
数据评估新归一化方法的性能,结果表明:该方法能够提高多变量统计模型的预测能力,
较完整地保留核磁共振谱的分子信息,有助于特征代谢物的识别。
其次,提出一类基于重采样技术的特征变量辨识方法。利用重采样技术,并结合T
统计和多变量分析方法,估算各变量的显著性,辨识特征变量。本文分别用模拟数据和
真实代谢组学数据检验新方
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