分子马达定运动物理机制研究.pdfVIP

研究生论文：《分子马达定向运动的物理机制研究》 Y．635789 摘 要 近年来，随着光钳技术(opticaltweezers)、基因组序Yt](sequence 晶体成像(x．ray crystallographer)分析以及荧光荧光显微镜(fluorophoreimage)等实验技术的发 展，使得人们可以对单个分子马达的生物结构和运动过程进行观测，从而积累了大量的实 验现象，为建立物理模型提供了基础。现已发现的分子马达有数百种，虽然它们在生物结 依据分子马达与轨道作用方式的不同，可将分子马达分为线性分子马达和旋转式分子马 力蛋白(dynein)和细菌鞭毛马达，讨论它们的生物学构造、物理学模型及其在生命活动中的 重要作用。通过近年有关肌球蛋白和驱动蛋白的生物化学实验研究，发现每种马达的头部 fHead core)，它们是动力作用 domain)都有包含结合ATP和结合轨道位点的催化核(catalytic andneck 的核心，且每种马达都有与动力作用有着密切联系的颈部(neck linker)。对分子马 达生物结构的研究，为建立物理模型和深入理解理解其定向运动机制奠定了基础。 motors)或者更为复杂的双头布朗马达 物理学上将分子马达简化为布朗马达(Brownian Brownian 模型(twocoupled 热棘轮模型是迄今为止最为成功的，本文介绍了两个典型的分子马达物理模型：一是势垒 部自由度的布朗马达。在此模型中，轨道是一列全同的小球，马达和轨道都被看成电偶极 子，其间的相互作用是电性的，相互作用的大小用分子马达绕轴心旋转的内部自由度的变 化来表示，且假设旋转是连续的，并用矩阵连分式的方法解析求解定向流的大小。 本文在热棘轮模型的基础上，提出了双布朗粒子闪烁热棘轮模型，分子马达与轨道的 作用用不对称势描述，用闪烁势描述ATP水解向分子马达提供能量的过程，为计算简单， 假设是势能变化于两态之间，两粒子之间的相互作用用谐振子势描述，用数值模拟的方法 解Langevin方程，得到了平均速度及其与各个参量之间的关系。给出了热噪声强度、跃迁 率和颈的长度(necklength)对定向运动的影响，发现定向流的大小和方向依赖于三者的耦 合，且颈的长度(necklength)的大小会引起定向流的反向。 型壅兰丝兰!!竺王兰竺塞旦堡垫塑塑些垫型翌窒! Abstract Inrecent the ofnew as years，with developmenttechnology,such optical tweezers and technique，sequence analysis，x—raycrystallographer hasbeenmadein image themolecular technique，greetprogress inthe the studiesof structureandmotor arehundredsof motilit