干旱胁迫下玉米录因子家族表达分析.pdf

摘要 摘要 干旱是影响玉米生产的主要限制因素，玉米干旱胁迫基因应答分子机制是 玉米分子育种的核心理论之一。植物转录因子能够与基因启动子区域的顺式作 用元件结合，抑制或激活转录，从而响应植物对干旱、高盐、低温、激素等一 系列环境胁迫因子的应答反应。目前对干旱胁迫下的玉米转录因子的应答缺乏 系统性分析，因此本文利用生物信息学方法和基于转录组的高通量数据比较， 研究玉米转录因子的表达特性，为玉米抗旱育种提供理论依据和基因材料。 以对干旱敏感程度不同的两种玉米旱21和掖478为材料，在苗期进行适度 干旱胁迫，整株混合取样提取总RNA并进行转录组测序，获取数字化基因表 达谱，并依此及ProFITS网站的玉米转录因子数据库为基础，对转录因子家族 显著表达的基因进行统计分析。结果表明：旱2l中，有166个转录因子基因显 著上调表达，186个转录因子基因显著下调表达；掖478中有315个转录因子 基因显著上调表达，有155个转录因子基因显著下调表达；有40个转录因子共 同显著上调表达，有26个转录因子共同显著下调表达。在对这些转录因子的数 字基因表达谱进行分析的基础上，利用基因本体论分析工具对涉及的代谢调控 网络进行了分析，发现这些基因参与了氮代谢、大分子物质代谢、RNA代谢、 信号传导细胞器合成及非生物胁迫等各个生物学途径。 以玉米旱2l和掖478及它们的杂交种Fl为材料，采用荧光实时定量PCR 方法对不同程度的干旱胁迫下转录因子家族中的ARF、AP2一EREBP及SBP家 族的部分成员的进行组织表达特异性分析。研究表明：在中度干旱胁迫下，ARF、 ERF及SBP基因在叶中均上调表达，在根中以下调表达为主；在重度干旱胁迫 下，ARF、ERF及SBP基因在根中均表现出下调表达的趋势，在叶中旱2l表 现为上调，掖478及Fl表现为下调。另外，ARF3和ARF5具有一种剂量效应。 关键词：玉米，干旱胁迫，转录因子，数字化基因表达谱，差异表达 Abstract isthe factorofmaize themolecular Droughtmajorlimiting production,and mechanismofmaize StFOSS isoneofthecorctheoriesof droughtgeneresponse maizemolecular factors to breeding．Throughplanttranscriptionbinding cis-elementsinthe toinhibitoractivatethe promoterregions transcription，mey toaseriesenvironmentalstressfactorssuchas respond of drought,saltstress，low arc ofmaize factorsto streSS temperature，hormone．Responsestranscriptiondrought understand．Inthisresearchthe characteristicsofmaize poorly expression are basedon methodsand factors bioinformatics tr