河川沙塘鳢群体传多样性及其系统进化研究.pdf

摘要 摘要 河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)又被称为沙塘鳢、虎头鲨、呆子鱼等。该鱼 作为长江中下游特色鱼类，被称为“上海世博第一鱼”。目前为止，有关河川沙塘鳢 的研究多集中于生物学、生理、营养代谢、毒理实验等方面，而关于沙塘鳢属鱼类的 种质资源研究较少。本文采用线粒体D．100p分子标记技术并结合核基因SRAP标记 研究我国河川沙塘鳢群体遗传多样性及5种虾虎鱼类的系统进化关系，在分子层次上 探讨其遗传变异水平，对河川沙塘鳢种质资源的遗传多样性进行评估，从而为河川沙 塘鳢的遗传多样性监测、不同地理群体之间的遗传分化、物种保护及其人工繁殖等研 究工作提供科学依据。本研究结果如下： 1、基于线粒体D．100p基因序列研究不同群体河川沙塘鳢遗传多样性 采用线粒体D．100p分子标记技术对河川沙塘鳢5个地理群体共150个个体(安徽 测中得到23个单倍型，且每个群体都有自己特有的单倍型。河川沙塘鳢表现为高的 D和Fu’S 单倍型多样性(0．80510)和低的核苷酸多样性(0．04028)。由中性检澳1](Tajima’S F)和核苷酸不配对分布可知，河川沙塘鳢没有经历近期种群扩张，而是在群体的进化 过程中，平衡选择起主要作用，群体大小维持稳定状态。单倍型NJ树和网络图分析 结果表明，单倍型在群体间有明显分支，体现了明显的地理差异性。5个群体的&～IOVA 分析表明，所有群体间的变异占总变异的92．91％，而群体内变异占7．09％，提示了不 同群体的河川沙塘鳢间应进行单独管理和保护。 2、利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性 related 采用相关序列扩增多态性(Sequenceamplified 标记分析3个河川沙塘鳢自然群体(安徽省当涂(DT)群体、浙江省余姚(YY)群体、江 苏省太湖东西th(DXS)群体)的遗传多样性。从196对引物组合中筛选出ll对扩增条 带清晰、稳定的引物组合对3个群体进行扩增，共获得71个位点。3个群体内多态 位点比例为6．90％．24．14％，其中DT群体多态位点比例为6．90％，YY群体多态位点 T 摘要 体聚为单独的一支。进一步证实，3个河川沙塘鳢自然群体有较低的遗传多样性。 3、基于线粒体D．100p基因序列研究我国5种虾虎鱼类的系统进化关系 yaluensis)、中华沙塘鳢(Odontobutissinensis)、葛氏鲈塘鳢(Perccottusglenii)及尖头塘 bp、 华沙塘鳢、葛氏鲈塘鳢及尖头塘鳢线粒体D．100p区全序列分别为853bp、853 1028bp、852bp、848 platycephala)、刺盖塘鳢(Eleotris 塘鳢(Eleotris fusca)、中华乌塘鳢(Bostrychus 2种虾虎鱼类 marmorata)、溪鳢(Rhyacichthysaspro))[a-J源的D．100p区序列，分析了1 的系统发育关系。所使用的同源序列长度为832．846bp，其中保守位点452个，变异 位点405个，简约信息位点258个，单态位点145个，转换／颠换平均值为O．8。基于 Kimura 2-parameter模型构建的邻接树和非加权配对法系统树中，河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、 中华沙塘鳢、平头沙塘鳢聚为一大支，刺盖塘鳢、黑体塘鳢、褐塘鳢、尖头塘鳢、溪 鳢、葛氏鲈塘鳢聚为另一支。 同时对5种虾虎鱼类(河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、中华沙塘鳢、葛氏鲈塘鳢及尖 头塘鳢)的线粒体D．100p结构进行比较分析，5种鱼类线粒体DNA控制区结构与其他 associated 鱼类类似，分为终止序列区