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深海宏基因组文活性物质筛选及深海真菌活性物质的筛选和研究.pdf
摘要
摘要
海洋是地球最重要的生态系统之一。由于海洋尤其是深海生态环境的特殊
性,深海微生物具有一些特异的代谢途径和遗传背景,深海微生物次生代谢产物
具有化学结构奇特、新颖,生物活性多样等特点。对深海微生物尤其是极端环境
微生物的研究开发将会在工业、医药、环境保护等方面具有潜在的、巨大的应用
价值。
微生物蕴藏着巨大的菌种与基因资源,但仅有0.1%~1%的微生物在现有技
术条件下能够培养。宏基因组技术避开了微生物培养和分离,极大地扩展了微生
物资源的利用空间,是开发利用未培养和非培养微生物的有效途径。
本文以“亚特兰蒂斯”号科考船于2009年11月在墨西哥California海湾瓜伊马
斯深海热液口所采集的样品和中国大洋一号第20航次采集的深海沉积物样品为
材料,构建3个高质量的环境文库和6个富集样品文库。从其中4个富集样品宏基
因组文库12500个克隆子中得到17株产生颜色的克隆子。对这17株产颜色的克隆
子的乙酸乙酯萃取粗提物浸膏,分别进行了细胞毒活性和抗真菌活性的筛选。实
验表明,这17株克隆子都具有不同程度的抗真菌活性,而其中ll株具有不同程度
的细胞毒活性。
对其中5株产生红色物质的克隆子做了转宿主、插入突变研究,发现宿主红
色物质的产生是由于外源基因的表达。突变子测序结果表明,这5株克隆子都含
有与芳香族降解有关的基因簇。其中,2个克隆子(7F12和17F9)可产生水溶性
棕黑色色素,突变子测序结果表明两株克隆子中,水溶性棕黑色色素的产生与
4HPPD酶(4-Hydroxyphenylpyruvatedioxygenase)有关。
测序分析发现,17F9包含4HPPD基因和调控因子TyrR;7F12全长测序结果
bacterium
表明,基因11为也包含4HPPD酶,编码348氨基酸,与Alteromonadales
TW二7(348氨基酸)97%同源。
另一方面,本文利用中国大洋一号第20航次采集的深海沉积物样品进行了真
菌富集分离和鉴定。从27份深海沉积物样品中分离出110株真菌,分属于15个属。
利用CCK8法对其中的100株深海真菌进行了抗肿瘤活性检测,发现深海真菌具有
摘要
良好的生物活性,细胞毒阳性率占49%。其中GYP培养基条件下有36株表现出抗
肿瘤活性,PDA培养基条件下有34株表现出抗肿瘤活性。同时,不同培养基条件
真菌粗提物活性也表现出明显差别。该研究为后期分离鉴定深海真菌产生的生物
活性化合物奠定了良好基础。
关键词:微生物资源;宏基因组;活性物质
Ⅱ
Abstract
Abstract
the of
Marineistheofmost in earth.Because
important particularity
ecosystem
ofmarine somecharacteristic
especiallydeep-sea,themicroorganismpossesses
metabolic metabolic havethe
background.Andsecondary
pathwaygenetic products
characteristicof andnovelchemicalconstruction.Itis and
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