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水稻白叶枯病候抗性基因的RGAs克隆及分析.pdf
水稻白叶枯病候选抗性基因的RGAs克隆及分析
摘 要
作为世界主要粮食作物之一,水稻对解决人类粮食安全问题有重要意义。白
叶枯病是仅次于稻瘟病的水稻第2大病害,会造成水稻大量减产甚至绝收。化学
防治虽然一定程度上能减轻病害,但其成本相对较高,容易引起病原物抗药性,
并且对环境造成长期污染。与之相比,培育抗性品种无疑是一种更为经济、有效
和安全的方式。
疣粒野生稻中存在众多未知抗病基因,它在整个生育期对白叶枯病都表现高
抗,甚至免疫。本研究利用抗病基因同源序列(resistance
geneanalogs,RGAs)
法,根据NBS类R基因的保守区核苷酸序列设计简并引物,从白叶枯病感病轮
回亲本栽培稻8411及其与疣粒野生稻进行体细胞杂交后得到的稳定高抗白叶枯
病新种质SH5、SH76基因组中克隆到3个520
bp左右的NBS抗病基因同源序
列,以此为探针从水稻基因组中筛选到2个推测的NBS—LRR抗病同源基因,暂
行了研究,结论如下:
1.克隆获得的NL-SH76基因组序列与预测基因有99%的同源性,位于水稻
ll号染色体BAC克隆B1l12E06上,使用10余对引物对NL.SH76cDNA预测
编码区进行扩增,多次测序均未发现预期目的片段,其是否为编码区序列,尚需
进一步实验。
2.克隆获得的NL.8411a基因组序列与预测基因有96.1%的同源性,位于水
RT-PCR技术从水稻SH5和SH76
cDNA中扩增出NL.8411a基因的完整编码区,
该编码区序列长度为3105
bp,编码1034个氨基酸,氨基酸序列分析显示其具备
CC-NBS.LRR类植物抗病基因的结构特征。
3.半定量RT-PCR分析表明,在取样时间范围内,NL.8411a的表达在抗、
感品种中存在显著差异,且受到水稻白叶枯病菌Zhel73的诱导。
其NBS保守区序列与番茄何基因最为接近,P矿基因对与水稻白叶枯菌来源相
似的假单胞菌属丁香假单胞杆菌番茄致病菌变种有相关抗性。并发现NL.8411a
在水稻品种日本晴中的等位基因为单拷贝。
5.对NL一8411a基因电子定位发现其处于水稻ll号染色体物理图谱的长臂
末端,但与11号染色体上已定位或克隆的8个白叶枯病抗病基因均具有不同序
列或处于不同的染色体位置。
本研究以水稻白叶枯病抗性种质为材料,以非抗性亲本为对照,增强了所克
隆RGAs的抗病针对性,结合生物信息学分析和RT-PCR技术克隆到一个与水稻
白叶枯病抗性相关的候选基因NL一8411a,为后续研究奠定基础。
关键词:RGAs法;水稻;白叶枯病抗性基因;克隆;表达分析
RGASCLONINGANDANALYSISOFACANDIDA,TE
RESISTANCEGENEToRICEBACTERIALBLIGHT
ABSTRACT
oneofthe food inthe
satire important world.Bacterial
Rice(OryzaL.)is crops
cause lossofrice andevenleadtolose
blight(BB)Callgreat yield production
chemicalscarlcontrolthediseasetosome costis
completely.Although extent,the
alsoinduce tohaveresistanceandcause
relativelyhigh.Chemicals pathogen
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