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第一章DNA，RNA 和蛋白质序列信息资源 1.数据库分类： 一次数据库：①基因组数据库 ②核酸和蛋白质一级结构序列数据库 ③生物大分子（主要是蛋白质）三维空间结构数据库 二次数据库（专门数据库，专业数据库，专用数据库）：根据以上三类数据库和文献资料为 基础所构建。 2.三大核酸序列数据库  GenBank: 美国国家医学图书馆的国家生物技术中心（NCBI）构建和维护，来自 世界各地数据。是具有目录和生物学注释的核酸序列综合数据库；GenBank 数据库 的序列数据来源于序列发现者提交的序列、批量提交的表达序列标签 （expressed sequence tag, EST ）、基因组测序序列 （genome survey sequence, GSS ）和其他测序中 心提供的高通量数据，还包括美国专利商标局提供的已发表专利的序列数据；NCBI 的 BLAST 程序提供 GenBank 和其他序列数据库中序列相似性搜索服务；通过 NCBI 的检索系统（Entrez）可以进入GenBank 。Entrez 检索程序整合了主要的 DNA 和蛋 白序列数据的分类学、基因组、图谱、蛋白结构和结构（功能）域信息，还包括相 关的PubMed 的生物医学文献信息。 GenBank 记录和分类： 表达序列标签(EST) 序列标签位点(STS)、基因组勘测序列(GSS)和环境样品序列(ENV) 高通量基因组(HTG)和高通量cDNA(HTC)序列 全基因组鸟枪测序序列(WGS) 转录组鸟枪组合序列 特殊记录类型：第三方注释（TPA ） GenBank CON 记录 较小记录组合记录 EMBL：欧洲生物信息中心（EBI））构建和维护，来自世界各地数据. DDBJ ：信息生物学中心和国家遗传研究生的日本DNA 数据库构建，主要来自日本的数据。 三大数据库每天都会进行数据交换，以保证数据库内容在全世界范围的同步性。 3.特殊类型核酸序列数据库 非编码RNA 数据库（ncRNA）； 表达序列标签数据库（dbEST ）； 序列标签位点数据库（dbSTS ）； miRBase ； tRNAdb 等。 4.基因组相关数据库 人类基因组数据库（HGD）； 基因组序列数据库（GSDB ）； 基因组在线数据库（GOLD ）等 5.核酸三维结构数据库 核苷酸三维结构数据库（NDB） 普纳大学核酸结构数据库（BNASDB） 6.基因表达数据库 基因表达库（GEO ）； 斯坦福微阵列数据库（SMD ）； ArrayExpress ； CGED； GXD ； BodyMap 等。 7. 人类基因突变及疾病相关数据库 人类基因变异数据库（HMGD）；人类遗传双等位基因序列数据库（HGBASE）；人类 孟德尔遗传在线（OMIM ）、国际单体型计划（HapMap）、人类单核苷酸多态性数据 库（dbSNP ）、肿瘤基因数据库（TGD B）、疾病关联数据库（GAD ）、癌症基因数据库 （CGAP ）、人类表观遗传数据库（HEP）、人类DNA 甲基化与癌症数据库（MethylCancer） 等。 8.其他重要的核酸序列数据库 dbEST ：dbEST 是GenBank 中的一个子数据库，包含来源于不同物种的表达序列数据 和表达序列标签序列的其他信息。 ncRNAdb：非编码RNA （non-coding RNA ncRNA ）数据库旨在提供非编码RNA 的序列 和功能信息。 miRBase：miR