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柔红霉素与DNA作用的序列特异性研究
Vo1.24 高 等 学 校 化 学 学报 NO.8
2003年 8月 CHEM ICALJOURNAL OF CHINESEUNIVERSITIES 1395~ 1399
柔红霉素与DNA作用的序列特异性研究
程圭芳,张冬梅 ,丁 敏 ,屈海云,何品刚,方禹之
(华东师范大学化学系,上海 200062)
摘要 采用紫外一可见光谱法和紫外一可见光谱 电化学法研究了柔红霉素 (DNR)与不同寡聚核苷酸之间的相
互作用.结果表明,DNR优先作用于寡聚核苷酸的CpG位点,然后是 ApG和ApC.因为DNR可与鸟嘌呤
之间形成 3个氢键.与双链寡聚核苷酸作用时,DNR最先插入的位点是 (CpG)碱基对之间.其次是 (TpG)
(CpA)和 (GpC)(ApC)碱基对之间.当DNR与存在未配对 G碱基的DNA链作用时,因游离的DNR量增加
使其 电化学活性增加,导致DNA构象和构型的变化,使DNA生理功能受到损伤,DNA碱基增色效应显著
上升.此法可用于G碱基未配对 DNA链 的检测.
关键词 柔红霉素;蒽环类抗癌药物;DNA;序列特异性;光谱电化学
中图分类号 0657 文献标识码 A 文章编号 0251—0790(2003)08。1395。05
柔 红霉素 (DNR)是一种典型的蒽环类抗癌药物[ ,此类药物在体 内的作用主要有:(1)嵌入
DNA链 中,使DNA分子构象发生变化,抑制DNA 的复制和 RNA依赖的RNA酶的合成[。;(2)在
NADH脱氢酶作用下,还原产生半醌 自由基;同时在有氧条件下介导活性 自由基,如超氧阴离子 自由
基(02’)和羟基 自由基 (OH一),引起细胞膜脂质过氧化,造成细胞毒性和心脏毒性[;(3)与线粒体
DNA,特别是与心磷脂DNA特异结合,生成复合体 I和 I,进而抑制呼吸酶的活性[阳和心脏毒性.
研究表 明,蒽环类药物对 DNA链 的嵌插作用与其抗癌活性之间有密切 的关系[引.但药物分子与
DNA的低特异性结合往往是其毒副作用的基础,鉴于 目前许多与DNA结合的药物作用序列特异性尚
属未知,尤其是从核酸的分子识别出发,包括序列选择性、位点专一性及形状选择性仍是当前药物研
究的热点之一[7].Wang等[8]用x射线衍射方法研究了d(CGTACG)和柔红霉素加合物的性质,结果
表明,DNR能够嵌入 DNA小沟区中的GC部位.ChiresE们采用DNaseI足迹印记法研究后发现DNA
对 DNR的高亲和序列是CA,中度亲和位点是 GC,CG,CT,TC,CC和AC.Stfania等[采用 H
NMR和。PNMR研究DNR等 3种系列衍生物在溶液中与寡聚核苷酸d(CGATCG)2和d(CGTACG)2
加合物的结构及加合过程的动力学,发现DNR的衍生物嵌在寡聚核苷酸AT碱基对之间,并且衍生
物的糖环处于DNA双螺旋的中间部位,所得结果与药物一DNA 固体加合物X射线衍射研究结果相反.
说明DNR和DNA作用的位点在溶液和固体状态下有很大的差异.药物进入体 内后代谢产生的中间
体和代谢产物与DNA作用机制往往是药物药理和毒理作用的主要因素.
光谱 电化学是一种新兴的交叉学科方法[1 ],具备了光谱学和常规电化学方法的各 自优点,特别
适用于研究药物与DNA之间在模拟体 内代谢动态条件下的相互作用机理,因而可更详细地、全面地
了解药物作用的选择性及其药理和毒理作用.本文采用光谱电化学方法研究DNR与DNA作用的序
列特异性,可为药物临床应用提供有力依据.对临床医学研究和药理学研究具有重要意义.
1 实验部分
1.1 试剂与仪器
柔红霉素 (上海药物检验所提供,未经过进一步的提纯);寡聚核苷酸 ssl(5GCGGCCGCGC
3 ),ss2(5 ATATATATAT 3 ),ss3(5 ATCACAGTTAAATTGC 3,),ss4(5 GCAATT一
收稿 日期:2002—03—06.
基金项 目:国家 自然科学基金 (批准号 资助.
联系人简介:方禹之 (1931年出生),男,教授,博士生导师,从事生物电化学、光谱电化学和毛细管电泳等方面的研究
高等 学
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