核酸的结构与功能11.pptVIP

原核生物核糖体小亚基rRNA的三维结构 原核生物核糖体大亚基rRNA的三维结构 （三）mRNA的结构 DNA的转录产物，蛋白质的翻译模板 原核生物多为多顺反子 真核生物多为单顺反子，5′-端具有帽子，3′-端具有多聚腺苷酸尾巴。 出现在mRNA分子上最多的二级结构部件也是茎环结构。mRNA分子的二级结构，特别是两端的二级结构对于翻译有影响，而某些mRNA借助于末端特殊的二级结构对基因的表达进行调控。 AAAAAAA-OH 5′ “帽子” PolyA 3′ m7G-5′ppp-N-3 ′ p 真核细胞mRNA的结构特点 O型： m7G 5’ -ppp5’-Np- I： m7G 5’ -ppp5’-Nmp-Np- II: m7G 5’ -ppp5’-Nmp -Nmp -Np- ★? 5’-帽子：m7G 5’ -ppp5’-Nm（ Nm ）p- 甲基鸟苷5’，5’-三磷酸 1 11 11 19 14 3 双螺旋稳定的因素 1） 氢键 氢键固然重要，但它们主要决定碱基配对的特异性，而对双螺旋稳定的贡献不是最重要的。对双螺旋稳定起决定性作用的是碱基的堆集力。 2） 碱基堆集力 这是碱基对之间在垂直方向上的相互作用所产生的力。它包括疏水作用和范德华力。碱基间相互作用的强度与相邻碱基之间环重叠的面积成正比。总的趋势是嘌呤与嘌呤之间嘌呤与嘧啶之间嘧啶与嘧啶之间。另外碱基的甲基化能提高碱基的堆积力。 3） 阳离子或带正电荷的化合物对磷酸基团的中和。 该模型揭示了DNA作为遗传物质的稳定性特征，最有价值的是确认了碱基配对原则，这是DNA复制、转录和反转录的分子基础，亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提出是本世纪生命科学的重大突破之一，它奠定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的基石。 4 DNA双螺旋结构的意义 （二） A和Z型双螺旋结构 影响双螺旋构象主要因素; Δ 碱基组成和序列 Δ 盐的浓度和种类 Δ 相对湿度 相对湿度92%：B—DNA 相对湿度75%：A—DNA。 （1）?B—DNA：典型的Watson-Crick双螺旋DNA 右手双螺旋 每圈螺旋10.4个碱基对 螺距：3.32nm （2）? A-DNA 右手双螺旋，外形粗短。 RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子具有这种结构。 （3）Z-DNA 左手螺旋，外形细长。 天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA。 DNA双螺旋的ABZs A-DNA A-RNA 大沟 小沟 A型双螺旋 B型双螺旋 Z型双螺旋 外形 短而宽 长而瘦 长而细 每碱基对上升距离 0.23nm 0.332±0.19nm 0.38nm 螺旋直经 2.55nm 2.37nm 1.84nm 螺旋方向 右手 右手 左手 螺旋内每重复单位的bp数 1 1 2 每圈bp数 ～11 ～10 12 碱基夹角 32.7° 34.6° 60°/2 螺距 2.46nm 3.32nm 4.56nm 碱基对倾角 ＋19° 1.2°±4.1° －9° 螺旋轴位置 大沟 穿过碱基对 小沟 大沟 极度窄、很深 很宽，深度中等 平坦 小沟 很宽、浅 窄，深度中等 极度窄、很深 糖苷键构象 反式 反式 C为反式，G为顺式 糖环折叠 C3′内式 C2′内式 嘧啶C2′内式，嘌呤C3′内式 存在 双链RNA，RNA/DNA杂交双链，低湿度 DNA（75％） 双链DNA（高湿度，92％） 嘧啶和嘌呤交替存在的双链DNA或DNA链上嘧啶和嘌呤交替存在的区域 A型双螺旋、B型双螺旋和Z型双螺旋的比较 （三） DNA的非标准二级结构 细胞内的DNA在特殊的条件下还可能形成其它几种非标准的二级结构。这些特殊的条件包括：DNA受到某些蛋白质的作用（如组蛋白）；DNA本身所具有的特殊基序，例如反向重复序列，回文结构，镜像重复，直接重复，高嘌呤序列，高嘧啶序列，富含A序列和富含G序列。 1）弯曲 2）十字形 3）P-DNA 4）三链螺旋与H-DNA 5）四链螺旋与G-四联体 6）滑动错配DNA（SMP-DNA） 十字形DNA的形成 P-DNA与B-DNA的比较 滑动错配DNA 二 DNA的三级结构——超螺旋 如果通过某种手段使得DNA双螺旋每一圈的碱基对数目多于或少于10对，将导致DNA双螺旋缠绕过多或缠绕不足；如果这时的DNA两端被固定或者DNA本来是共价闭环的张力无法释放而自发地形成超