《基于SSR标记的肇庆地区柑橘品种分类地位研究》.pdfVIP

中国摩擘c亟握 2014，30(4)：137-143 ChineseAgriculturalScienceBulletin 基于SSR标记的肇庆地区柑橘品种分类地位研究 郭雁君 ，曾继武 ，胡亚平 ，郭丽英 ，蒋 惠 ，周希琴 ，吉前华 (肇庆学院果树研究所，广东肇庆 526061；广东省农业科学院果树研究所，广州518040) 摘 要：评价广东省肇庆地区地方柑橘品种与其他部分柑橘属和近缘属植物的亲缘关系，为其分类和育 种提供理论依据。从34对柑橘SSR引物中筛选到13对多态性较好的SSR引物，对8份肇庆地方柑橘品 种和22份柑橘属、枳属、酒饼筋属植物材料进行PCR扩增，并采用1．5％琼脂糖凝胶电泳检测，用遗传相 似性和聚类分析等方法分析检测结果。13对引物共扩增出83条谱带，多态检 出率为100％，通过聚类分 析能够有效的区分柑橘属、枳属和酒饼筋属，以及柑橘属 内的种、品种甚至品系。结果表明SSR分子标 记技术能够用于肇庆柑橘种质资源分类地位研究，并且供试的肇庆地方柑橘品种亲缘关系较近。 关键词：柑橘 ；SSR；聚类分析；亲缘关系 中图分类号：$602．4 文献标志码：A 论文编号：2013—1625 ClassificationofZhaoqingLocalCitrusGermplasm ResourcesBasedon SimpleSequenceRepeatM olecularM arkerAnalysis GuoYanjun，ZengJiwu，HuYaping，GuoLiying，JiangHui，ZhouXiqin，jiQianhua (FruitTreeResearchInstitute，ZhaoqingUniversity，ZhaoqingGuangdong526061； FruitTreeResearchInstitute，GuangdongAcademyofAgricuhuralSciences，Guangzhou518040) Abstract：TheresultsofpresentstudyintheevaluationofgeneticrelationshipbetweenZhaoqinglocalcitrus germplasmandotherciturscuhivarstogetherwithrelatedgenerabysimplesequencerepeat(SSR)molecular markertechniquehadprovidedsolidsupportingevidencesfortheirclassificationandbreeding．Thisthesis selected13pairsofSSRprimerswithbetterpolymorphism from 34pairsofSSR citursprimersandcarriedout PCR amplification in 8 samplesofZhaoqinglocalcitruscuhivars，20 samplesofothercitruscultivars，1 sampleofPoncirusand1sampleofAtalantia(usedasout·~oup)，withtheamplificationproducttestedin1× TBEbuffersolutionusing1．5％ agarosegelelectrophoresis．ClusteranalysiswasperformedusingUPGMA， andaclustertreewasbuiltusingtheNTSYSpc2．1analysissoftware，with thegeneticsimilaritycoefficient calculated．A total of13primerpairswithhilghpolymorphism wereselectedrfom the34pairsofSSR．The codesofprimer