第01讲 微生物基因组学.ppt

测序微生物的类别 几乎所有类别的病毒 模式微生物 极端环境微生物 病原原核生物 环境降解微生物 其他 基因组学回答有趣的问题示例二 衣原体(Chlamydiae)是非运动的球形G－细菌，它只能在真核细胞细胞质的泡囊中以独特的生命周期进行繁殖。它的基因组测序已经揭示了几个惊人的结果。 因为该菌的生命周期非常特别，人们曾预期它的基因组可能也很特殊。但事实并非如此，它的基因组于其它许多细菌基本都是一样的。 第一个被测序的细胞生物 --流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae) H.influenzae是由Pfeiffer于1892年流感世界大流行时，从病人鼻咽部分离出的短小杆菌，当时认为它就是流感的病原菌，不过事实并非如此。 基因组大小为1.8Mb,含有1743的基因，在细菌基因组中较为典型；其G＋C含量为38％，与人类基因组十分接近。 基因组的测序和初步的注释工作由Fleischmann RD (TIGR)等于1995等完成并报道（ Whole-genome random sequenc-ing and assembly of Haemophilus influenzae ,Science 269(5223): 496-512, 1995 ）。 H. influenzae基因组测序的意义 20世纪90年代，关于WGS（Whole genome sho