《南方水稻黑条矮缩病毒湖南分离物S9片段ORF序列分析》.pdfVIP

圣氩铃镰始 2014，40(3)：138—142 PlantProtection 南方水稻黑条矮缩病毒湖南分离物 S9片段 ORF序列分析 凌晓曦 ， 刘 勇 ， 张松柏 ， 匡 炜 ， 彭 静 ， 周灏明。， 张德咏 (1．湖南农业大学植物保护学院，长沙 410128；2．湖南省植物保护研究所 ，长沙 410125) 摘要 本文克隆了湖南省 2011～2013年水稻的 15个 SRBSDV分离物 S9两个基因，并测定了其核苷酸序列，序列 分析与比较表明，s9两个ORF序列同源性均大于99．5 。突变位点分析表明，S9编码的两个ORF有3～9个突 变位点，但大部分的核酸突变为无义突变。系统发育分析表明，S9编码的两个 ORF高度同源，处于相同的的系统 发育分支。 关键词 南方水稻黑条矮缩病； ORF； S9片段 ； 序列分析 中图分类号 ： S432．41 文献标识码： A DOI： 10．3969／j．issn．0529—1542．2014．03．025 SequenceanalysisofORFsofsegment9ofHunan isolates ofSouthernriceblack．streakeddwarfvirus LingXiaoxi， LiuYong ， ZhangSongbai， KuangWei， PengJing ． ZhouHaoming ， ZhangDeyong’ (1．CollegeofPlantProtection，HunanAgriculturalUniversity，Changsha 410128，China； 2．HunanPlantProtectionInstitute，Changsha 410125．China) Abstract Thefull—lengthsequencesoftwoORFsofthegenomesegment9 (S9)ofSouthernriceblack—streaked dwarfvirus(SRBSDV)isolatescollectedindifferentregionsofHunanProvincewasclonedandsequenced．The homologybetweenthetwoORFsofS9in5isolateswashigherthan99．5％ ．Therewas3--9mutationsitesinboth ORFs，butmostofthem werenonsense．TheresultsofphylogeneticanalysisshowedthatbothORFsfrom differ— entvariantssharedhighlevelofsequenceidentityandgatheredinthesamecluster． Keywords Southernriceblack—streakeddwa v‘irus； ORF； segment9； sequenceanalysis 南方水稻黑条矮缩病毒 (Southernriceblack— DV编码 6个结构蛋白(P1、P2、P3、P4、P8、P10)和 7 streakeddwar厂virus，SRBSDV)于 2001年在广东 个非结构蛋 白(P5l、P5—2、P6、P7—1、P7—2、P91、P9 省阳西县首次发现l1]，2008年被正式鉴定为呼肠孤 2)；推测结构蛋 白P1为病毒 RNA依赖 的RNA聚 病毒科 (Reoviridae)斐济病毒属(Fijivirus)第 2组 合酶，P2为病毒内核的组分，P3为帽子酶，P4为病 的一个新种l2]。2009年，该病在广东、海南、江西 毒外壳的B刺突蛋 白，P8为病毒的核心衣壳蛋 白， 和湖南等省的部分稻区暴发，据不完全统计，造成约 P10为病毒主要外层衣壳蛋白，其序列具有保守性， 6500hme水稻失收，受害面积达 30万hm2J。 是分类和鉴定病毒属种的重要依据