珠江流域野生黄颡鱼+Pelteobagrus+fulvidraco+的Cyt+b基因序列分析.pdfVIP

第５４卷　第５ 期 中山大学学报 （自然科学版） Ｖｏｌ５４　Ｎｏ５ 　 ２０１５ 年　９ 月 ＡＣＴＡ　ＳＣＩＥＮＴＩＡＲＵＭ　ＮＡＴＵＲＡＬＩＵＭ　ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＡＴＩＳ　ＳＵＮＹＡＴＳＥＮＩ Ｓｅｐ　２０１５ 　 ＤＯＩ：１０１３４７１／ｊｃｎｋｉａｃｔａｓｎｕｓ２０１５０５０２０ 珠江流域野生黄颡鱼Ｐｅｌｔｅｏｂａｇｒｕｓｆｕｌｖｉｄｒａｃｏ 的 Ｃｙｔ ｂ基因序列分析 １，２ １，３ ２ １，３ １ １ 张鹤千 ，杨子拓 ，李桂峰 ，肖诗斌 ，孙际佳 ，杨慧荣 ， １ １ １，３ １，３ 赵会宏 ，谢堂晖 ，韩兴鹏 ，刘　丽 （１．华南农业大学动物科学学院，广东广州５１０６４２； ２．中山大学生命科学大学院，广东广州５１０２７５； ３．华南农业大学动物科学学院 广东省农业动物基因组学与 ∥ 分子育种重点实验室，广东广州５１０６４２） 摘　要：利用ＰＣＲ技术扩增得到珠江水系５ 个江段共 １９０ 尾野生黄颡鱼Ｐｅｌｔｅｏｂａｇｒｕｓｆｕｌｖｉｄｒａｃｏ 样品的线粒体 ＤＮＡ细胞色素ｂ （Ｃｙｔ ｂ）基因片段，并测定其序列，确定野生黄颡鱼的Ｃｙｔ ｂ基因片段全长为１ １０９ ｂｐ。在 １９０ 尾样品中检测到４３种不同的单倍型，单倍型多样性 （Ｈ ）和核苷酸多样性 （Ｐ ）分别为０８４８ ５７ 和００４ ８１７，ｄ ｉ 呈高单倍型、低核苷酸多样性的分布模式，表明其遗传多样性属于中等水平。利用ＣｌｕｓｔａｌＸ １８１ 和ＭＥＧＡ ５０ 软件对１９０尾样品进行同源基因序列分析，其Ａ＋Ｔ含量 （５５１％）显著高于Ｇ＋Ｃ含量 （４４８％），碱基组成 差异不大，分布比较平均。使用最大似然率法构建分子系统发生树，结果表明都匀江段与左江江段的遗传分化 程度最大 （Ｆ ＝０４１４ ３０）。ＡＭＯＶＡ分析显示，珠江水系野生黄颡鱼的遗传变异均来自群体内，达到７５２３％， ｓｔ 表明地理因素对黄颡鱼的遗传分化产生了一定的影响，聚类结果与地理分布存在一定的相关性。中性检验结果 表明，各群体间没有发生过种群扩张，种群数量相对稳定。 关键词：黄颡鱼；珠江流域；遗传多样性；Ｃｙｔ ｂ 中图分类号：Ｑ９５３５　　文献标志码：Ａ　　文章编号：０５２９ －６５７９ （２０１５）０５ －０１０２－０７ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ Ｃｙｔｂ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｉｎ Ｐｅｌｔｅｏｂａｇｒｕｓｆｕｌｖｉｄｒａｃｏ ｆｒｏｍ ｔｈｅ Ｐｅａｒｌ Ｒｉｖｅｒ １，２ １，３ ２ １，３ １ ＺＨＡＮＧＨｅｑｉａｎ ，ＹＡＮＧＺｉｔｕｏ ，ＬＩ Ｇｕｉｆｅｎｇ ，ＸＩＡＯＳｈｉｂｉｎ ，ＳＵＮＪｉｊｉａ ， １ １ １ ，１，３ １，３ ＹＡＮＧＨｕｉｒｏｎｇ ，ＺＨＡＯＨｕｉｈｏｎｇ ，ＸＩＥ