江蓠科5种海藻cox1、58S rDNAITS、rbcL和rbc spacer序列分析的分子系统学及研究.pdf

江蓠科5种海藻coxl、5 spacer序列分析及分子系统学研究 摘要 原料，具有很高的经济价值。但是由于其种类繁多、形态结构简单等原因，江蓠 科海藻属和物种的分类鉴定仍存在着较多的争议。本文扩增并测序了江蓠属 chouae)、真江蓠(G． (Gracilaria)的芋根江蓠(G．blodgettii)、脆江蓠(G vermiculophylla)、细基江蓠繁枝变种(Gvar．1iui)和龙须菜属 tenu括tipimta 因组的coxl部分序列、核基因组5．8SrDNA．ITS全长序列、叶绿体基因组的rbcL 和rbc spacer全长序列，并结合GenBank数据库中现有江蓠科海藻的相关序列， 在不同分类阶元水平探讨了序列变异及其系统进化关系。测序得到江蓠科海藻的 coxl和rbcL序列的长度分别为713 rDNA．ITS序列和rbc bp和1467bp；5．8S spacer在各物种中长度不一，分别在893bp-1508bp和65bp～131bp之间。所研 究的江蓠科5种海藻的coxl、rbcL、5．8SrDNA—ITS和rbc spacer种内遗传距离 2～17、2～10和1～3变异位点，群体内和群体间遗传变异较低；中国、俄罗斯和 美国真江蓠群体中，coxl、rbcL和5．8SrDNA．ITS序列分别存在着1、1和9个 与地理分布相关的信息位点，可以进行群体的有效区分，同时单倍型分析结果显 示，三个地理群体各自具有独特的单倍型。除去近缘种，江蓠科海藻的coxl、rbcL、 5．8S rDNA．ITS和rbc 藻的5．8S序列较为保守，具有稳定的属间信息位点，可用于江蓠科属水平上的 分类鉴定。构建的coxl、rbcL、5．8SrDNA．ITS系统发育树结果显示，江蓠科海 中Melanthalia分支处在系统树的最底部，可能是江蓠科较早分化出的一个属； 而Hydropuntia属的物种聚在江蓠属内并未单独聚到同一分支内，不存在明显的 IV 属间遗传分化，而龙须菜属明显区分于江蓠属独立聚为一支，因此Hydropuntia 属可视为江蓠属的以下的分类阶元，而研究结果支持龙须菜属独立于江蓠属的系 统分类观点。 rDNA—ITS； 关键词：江蓠科；江蓠属；龙须菜属；Hydropuntia；coxl：rbcL：5．8S rbc spacer：系统发育 V Molecular and of systematicsphylogenetics basedon andrbc species coxl，5．8SrDNA—ITS，rbcL spacer Abstract Gracilariaceanare distributedandhas inthe specieswidely greatvarietyworld， alsowith economicvalue．Butbecauseoftheirwide high andother are taxonomicof reasons，there plasticity man