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谨以此论文献给对我严格要求的导师,给予我无
私关怀的父母和一直支持帮助我的实验室同学们。
——丁艳
万方数据
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龙须菜热激蛋白基因克隆及在高温胁迫下的
表达模式分析
摘 要
龙须菜是一种重要的大型经济海藻,是生产琼胶的原料,也可以作为鲍鱼的
饵料,具有进行大规模栽培的价值。耐高温品种981和07-2龙须菜的培育,推
动了龙须菜栽培业的发展,但是在实际栽培过程中仍然面临过高的海水温度会限
制龙须菜的生长,导致溃烂甚至死亡等问题。为解决这些问题,培育性状稳定、
耐热性更强的龙须菜新品种是必要的,这需要研究龙须菜对高温的应答机制。研
究表明,热激蛋白 (HSP)是一类在生物体受到逆境胁迫时能提高机体耐受性的
逆境蛋白家族,在减轻逆境胁迫对机体的伤害方面起到很大作用。本论文对龙须
菜热激蛋白进行研究,旨在了解龙须菜的高温胁迫响应机制,为培育抗逆性更强
的龙须菜新品系提供理论依据。
本实验室前期通过构建龙须菜高温胁迫差异表达文库,获得了龙须菜hsp90
的cDNA序列,在此基础上,本论文克隆了hsp90 的全长序列,长为2605bp,
只由一个外显子组成,开放阅读框长2100bp,上游调控序列为505bp。该基因编
码699个氨基酸,含 N端保守的ATPase结构域,中间结构域和C端是保守的
5肽MEEVD。经Blast分析与角叉菜hsp90 的相似性最高,达到87%。该基因序
列在三种耐高温性能不同的龙须菜-野生型、981和07-2龙须菜中序列相同,通
过southernblotting验证该基因在三种龙须菜中拷贝数也相同,均为两个拷贝。
将本实验室前期获得的hsp70-1和hsp70-2与GenBank 中的序列比对,发现
与GenBank 中报道的龙须菜hsp70序列不同,可见龙须菜中还存在第三种hsp70
(命名为hsp70-3),但是对于hsp70-3仅有部分序列报道,在此基础上,本论文
克隆了hsp70-3 的全长序列,长为2780bp,开放阅读框全长 1867bp,基因上游
调控区长416bp,下游侧翼序列长495bp。该基因编码621个氨基酸,含有保守
的N端ATPase结构域和C端底物结合结构域。经Blast分析与细基江蓠hsp70
的相似性最高,达到91%。
本实验还通过分析 10种管家基因—肌动蛋白基因 (ACT)、 甘油醛-3-磷酸
脱氢酶基因(GAPDH)、 延伸因子基因1(EF1)、 转录起始因子基因 (eIF)、 组
I
万方数据
蛋白H2B基因 (H2B)、18S核糖体RNA 基因 (18SrRNA)、转录间隔区基因
(ITS2)、胞色素c氧化酶基因 (COX)、细胞色素还原酶b5基因(CR)、藻红
蛋白基因 (PEB)在不同温度胁迫下的表达情况,获得了龙须菜在温度胁迫条件
下合适的内参基因:a)32℃不同的热激处理时间实验,最适合的内参基因组合是
eIF 和 ACT。b) 8℃不同的低温处理时间实验,最适合的内参基因组合是
GAPDH、ITS2、CR、18SrRNA。c) 不同的处理温度实验,最合适的内参基因组
合是 eIF、 EF1、 ACT 。d) 龙须菜不同的生活世代实验,最合适的内参基因
组合是 GAPDH和 ACT。
采用荧光定量PCR 的方法检测hsp90和hsp70-3在高温(32℃)胁迫下在野
生型,07-2,981 中的转录水平。hsp90在三种龙须菜中的变化趋势是一样的,
均呈现先升高后降低再升高的趋势;从表
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