猪铁代谢相关基因的克隆、生物信息学分析及其表达分布.pdf

武宇晓铁代谢相关基因的克隆、生物信息学分析及表达分析 摘 要 以EST片段为基础，电子延伸获得新的编码基因，通过RT．PCR技术克隆得到相关 基因的cDNA序列，并利用生物信息学工具预测其相关生物信息学性质，为进一步探讨相 关基因的功能奠定基础，同时利用半定量RT．PCR方法分析了猪细胞色素b还原酶 猪Fe+3螯合物还原酶I(FRRSI)基因的时空表达规律并利用生物学软件对各基因相对应的蛋 白进行分析。试验成功克隆了猪细胞色素b还原酶I(CYBRDl)、猪配对的二价金属离子转 克隆的CYBRDl基因长960bp包含了完整的开放阅读框，编码285个氨基酸残基的蛋 信号肽的剪切位点，成熟肽疏水性强。CYBRDl开放阅读框与人、大鼠、小鼠同源性分别 个蛋白激酶磷酸化的位点和6段明显的跨膜区。二级结构预测表明CYBRDl蛋白前端及中 端有一个较长洳螺旋，近末端处主要是B一折叠和转角，末端处还有一个短的甜螺旋。组织 表达规律分析表明：CYBRDl在空肠表达量最高，在回肠有中度表达，在盲肠、结肠、直 基酸残基的蛋白质。 碱性氨基酸残基，疏水性火于亲水性。DMTI蛋白有9段明显的跨膜区和17个蛋白激酶磷 酸化的位点。开放阅读框与人、牛、大鼠、小鼠同源性分别为89．9％、91．1％、87．4％、